ไอโซเมอร์เป็นสารประกอบทางเคมีที่มีสูตรโมเลกุลเหมือนกันนั่นหมายถึงพวกมันประกอบด้วยอะตอมประเภทเดียวกันจำนวนเท่ากัน แต่มีโครงสร้างหรือการจัดเรียงต่างกันในอวกาศ ตัวอย่างเช่นเพ็นเทนเป็นสารประกอบอินทรีย์ที่ประกอบด้วยอะตอมของคาร์บอนห้าอะตอมและไฮโดรเจน 12 อะตอม สอง isomers ของเพนเทนรวมเพนเทน unbranched ซึ่งในการจัดเรียงเป็นเส้นตรงโซ่และ isopentane หรือ methylbutane ที่สี่จัดเรียงเป็นเส้นตรงในขณะที่ห้าแยกออกมาจากอะตอมคาร์บอนอะตอมภายใน ทั้งสองมีสูตรโมเลกุลเหมือนกัน แต่การจัดเรียงที่แท้จริงของอะตอมของพวกเขาแตกต่างกัน ไอโซเมอร์มีความสำคัญเนื่องจากสารประกอบที่มีโครงสร้างแตกต่างกันถึงแม้ว่าพวกมันจะมีอะตอมเหมือนกัน แต่ก็มีคุณสมบัติทางเคมีที่แตกต่างกันอย่างมาก
สารประกอบที่มีสูตรโมเลกุลเดียวกันอาจมีโครงสร้างแตกต่างกันในสองวิธี ข้อแรกโครงสร้างของไอโซเมอร์มีความแตกต่างในการจัดเรียงโครงสร้างจริงของอะตอม กลุ่มการทำงานที่ประกอบเป็นสารประกอบถูกรวมเข้าด้วยกันในวิธีที่ต่างกันและในการจัดเรียงที่แตกต่างกัน Stereoisomers ตรงกันข้ามจัดเรียงในลักษณะเดียวกันในแง่ของตำแหน่งหน้าที่กลุ่มต่าง ๆ ในตำแหน่งญาติ แต่ในพื้นที่ ยกตัวอย่างเช่นสองโมเลกุลอาจมีอะตอมเดียวกันและโครงสร้างเดียวกัน แต่อาจไม่ใช่ภาพซ้อนทับของกระจกซึ่งกันและกันและดังนั้นจึงเป็นไอโซเมอร์
ไอโซเมอร์มีความสำคัญมากเนื่องจากสารประกอบต่างกันถึงแม้ว่าพวกเขาจะมีสูตรโมเลกุลเดียวกันก็ตาม แต่ก็มีคุณสมบัติทางเคมีที่แตกต่างกัน นี่คือความจริงของสเตอริโอไอโซเมอร์ซึ่งมีผิวเผินเกือบเหมือนกัน ยกตัวอย่างเช่นสารประกอบหนึ่งอาจเป็นส่วนประกอบสำคัญในยาในขณะที่ไอโซเมอร์กระจกเงาที่ไม่ได้ซ้อนทับกันอาจไม่ได้ผลหรือเป็นอันตรายแม้แต่น้อย สารประกอบที่มีการจัดเรียงที่แตกต่างกันมักจะตอบสนองในรูปแบบที่แตกต่างกันอย่างมากกับอะตอมและสารประกอบอื่น ๆ พวกเขาอาจแตกต่างกันซึ่งสารเคมีที่พวกเขาทำปฏิกิริยากับหรือในอัตราที่พวกเขาทำปฏิกิริยากับสารเคมีต่างๆ
ปฏิกิริยาเคมีจำนวนมากก่อให้เกิดการผสมผสานของไอโซเมอร์ที่แตกต่างกัน - นี่เป็นความจริงโดยเฉพาะของสเตอริโอไอโซเมอร์ - ดังนั้นนักเคมีต้องใช้วิธีการต่าง ๆ เพื่อแยกไอโซเมอร์โดยเฉพาะที่พวกเขาสนใจ วิธีการต่าง ๆ มากมายตามคุณสมบัติทางเคมีต่าง ๆ สามารถใช้เพื่อแยก isomers สารประกอบบางตัวที่มีสูตรโมเลกุลเหมือนกันอาจจะต้มที่อุณหภูมิต่างกันดังนั้นการกลั่นจึงสามารถใช้แยกพวกมันออกได้ คนอื่นทำปฏิกิริยากับสารประกอบต่าง ๆ ดังนั้นปฏิกิริยาเคมีสามารถใช้เพื่อลบหนึ่ง isomer ในขณะที่ปล่อยให้สารประกอบที่น่าสนใจไม่เปลี่ยนแปลง
