Microfauna เป็นสัตว์ขนาดเล็กและสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวที่มองเห็นได้ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ โดยปกติแล้วพวกมันจะถูกกำหนดให้เป็นสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กกว่า 0.1 มม. (100 ไมครอน) โดยมี mesofauna เป็นสิ่งมีชีวิตระหว่าง 0.1 มม. และ 2 มม. ในขนาดแม้ว่าคำจำกัดความอาจแตกต่างกันไป
ในดิน microfauna สามารถพบได้ในจำนวนมาก - โดยทั่วไปหลายพันต่อกรัม ทุกคนสามารถใช้ดินเปียก ๆ วางไว้ใต้กล้องจุลทรรศน์และค้นหาสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ ตัวอย่างที่สำคัญและพบบ่อยที่สุดคือโปรโตซัว (ยูคาริโอตเดี่ยว), ไร (ในบรรดาสัตว์ที่มีความหลากหลายและประสบความสำเร็จมากที่สุด), สปริงเทล (เกี่ยวข้องกับแมลง), ไส้เดือนฝอย (สิ่งมีชีวิตหนอนใส), โรติเฟอร์ ciliated mouthparts) และ tardigrades ยังเป็นที่รู้จักกันในนาม "หมีน้ำ" หนึ่งในสิ่งมีชีวิตที่ยากที่สุดในธรรมชาติ พบสัตว์น้ำได้ทั่วโลกทุกที่ที่มีดินเปียกและที่อื่น ๆ เช่นกัน มีการค้นพบสปริงเทลในหุบเขาแห้งแล้งของแม็คเมอร์โดแห่งแอนตาร์กติกาซึ่งเป็นหนึ่งในสถานที่ที่หนาวที่สุดและแห้งแล้งที่สุดในโลก
Microfauna ประกอบไปด้วยจุลินทรีย์ซึ่งประกอบด้วยสาหร่ายแบคทีเรียเชื้อราและยีสต์สามารถย่อยสารอินทรีย์ใด ๆ และสารอนินทรีย์เช่น TNT และยางสังเคราะห์
สัตว์ขนาดใหญ่ที่พบในดินนั้นเรียกว่า mesofauna เช่นไส้เดือนอาร์โทรพอดและไส้เดือนฝอยขนาดใหญ่และ macrofauna ซึ่งรวมถึงสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่ขุดโพรงเช่นตุ่นและกระต่าย สัตว์ทะเลชนิดนี้มีความเข้าใจน้อยที่สุดเกี่ยวกับสิ่งมีชีวิตในดินเนื่องจากมีขนาดเล็กและมีความหลากหลายที่ดี หลายคนเป็นสมาชิกของสัตว์ที่เรียกว่า "cryptozoa" ที่ยังไม่ถูกบรรยายโดยวิทยาศาสตร์ จากสัตว์ที่มีประมาณ 10-20 ล้านสายพันธุ์ในโลกมีเพียง 1.8 ล้านชื่อที่ได้รับชื่อทางวิทยาศาสตร์และอีกหลายล้านที่เหลือน่าจะเป็นของกลุ่มนี้หลายคนอยู่ในเขตร้อน
สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมขนาดเล็กอาศัยอยู่ในรูขุมขนเล็ก ๆ ระหว่างเม็ดดินและอีกหลายชนิดเป็นสัตว์น้ำ บางคนนั่งซึ่งหมายความว่าพวกเขายึดติดกับพื้นผิวตลอดชีวิตของพวกเขาและไม่เคยย้าย สัตว์เหล่านี้ทำการผสมพันธุ์กับเพื่อนของพวกเขาโดยการปล่อยอสุจิ ciliated ในขณะที่พวกเขายังคงอยู่ พวกมันสามารถพบได้ในร่างกายมนุษย์เช่นกันและบ้านมนุษย์โดยเฉลี่ยมีไรหลายพันตัวที่ทำมาหากินโดยการย่อยเซลล์ผิวที่ตายแล้ว
