เอ็นไซม์ จำกัด เป็นเอ็นไซม์ที่รับรู้ลำดับดีเอ็นเอโดยเฉพาะและแยกออกจากกันโดยแยกสายดีเอ็นเอออกเป็นสองส่วนไม่ว่าพวกเขาจะพบลำดับที่ถูกเข้ารหัส มีแอปพลิเคชั่นจำนวนมากสำหรับเอนไซม์ที่ จำกัด ซึ่งอาจเป็นที่สะดุดตาที่สุดในเทคโนโลยีดีเอ็นเอ recombinant ซึ่งช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถจัดการข้อมูลทางพันธุกรรมได้ Recombinant DNA ใช้สำหรับทุกสิ่งตั้งแต่การพัฒนาผลิตภัณฑ์การรักษาเช่นอินซูลินสำหรับการรักษาทางการแพทย์ไปจนถึงการดัดแปลงพืช
เอนไซม์เหล่านี้แยกได้จากแบคทีเรีย ในแบคทีเรียพวกเขาปกป้องสิ่งมีชีวิตจาก DNA ต่างประเทศโดยการตัด DNA เมื่อร่างกายของแบคทีเรียได้รับการยอมรับ แบคทีเรียใช้เทคนิคที่เรียกว่าการปรับเปลี่ยนข้อ จำกัด เพื่อปกป้องตัวเองจากเอนไซม์ จำกัด ของพวกเขาเพื่อให้แน่ใจว่าเอนไซม์จะไม่เปิด DNA ของแบคทีเรียเอง ในฐานะที่เป็นกลไกการป้องกันตนเองเอนไซม์ จำกัด นั้นยอดเยี่ยมป้องกันการจำลองดีเอ็นเอต่างประเทศในร่างกายด้วยการแยกส่วน
มีการค้นพบเอนไซม์ จำกัด จำนวนมากและมีการค้นพบมากขึ้นเรื่อย ๆ ในกระบวนการที่เรียกว่าการทำแผนที่เอนไซม์ จำกัด ห้องปฏิบัติการหลายแห่งผลิตเอนไซม์ จำกัด เพื่อจำหน่ายให้กับนักวิจัยและห้องปฏิบัติการอื่น ๆ เอ็นไซม์ จำกัด แต่ละตัวถูกเขียนขึ้นเพื่อตอบสนองต่อลำดับนิวคลีโอไทด์โดยเฉพาะและลำดับมักจะเป็นแบบพาลินโดรมอ่านแบบย้อนกลับและไปข้างหน้าแบบเดียวกัน เมื่อเอ็นไซม์ จำกัด พบลำดับที่รู้จักมันจะตัดผ่านทั้งสองเส้นของโครงสร้างเกลียวคู่ของ DNA โดยแยกออก นอกจากนี้มันยังจะสร้างหลายชิ้นถ้ามันระบุมากกว่าหนึ่งสำเนาของลำดับที่รู้
เอนไซม์ จำกัด บางตัวตัดตรงข้ามเกลียวคู่เพื่อสร้างสิ่งที่เรียกว่าปลายทู่ คนอื่น ๆ ตัดที่จุดต่าง ๆ ในด้านอื่น ๆ ทำให้เกิดรอยหยักที่เรียกว่า "ปลายเหนียว" ในทั้งสองกรณีเอ็นไซม์ที่รู้จักกันในชื่อ DNA ligase สามารถนำมาใช้เพื่อเชื่อมดีเอ็นเอชิ้นหนึ่งกับดีเอ็นเอที่ถูกตัดตราบใดที่ทั้งสอง ส่วนมีปลายที่สมบูรณ์ เทคนิคนี้สามารถใช้ในการแทรก DNA ใหม่เข้าไปในจีโนมและเพื่อจัดการจีโนมเรียงลำดับของชิ้นส่วนที่เหมือนกันของสองปริศนาที่แตกต่างกัน
ในบางกรณีเอนไซม์การ จำกัด ถูกเข้ารหัสสำหรับสิ่งที่เรียกว่าการรู้จำที่ไม่คลุมเครือซึ่งหมายความว่ามันจะรับรู้ลำดับที่เฉพาะเจาะจงเท่านั้น คนอื่น ๆ ถูกเข้ารหัสเพื่อการจดจำที่ไม่ชัดเจนโดยมองหาลำดับที่นิวคลีโอไทด์เฉพาะเจาะจงยึดนิวคลีโอไทด์ใด ๆ การใช้เอนไซม์ จำกัด ที่รู้จักนักวิจัยสามารถเลือกตัวอย่างดีเอ็นเอเป็นชิ้นส่วนที่เรียกว่าชิ้นส่วน จำกัด ได้
