การวิจัยทางวิทยาศาสตร์เกือบทั้งหมดมาพร้อมกับความเสี่ยงและนาโนสเกลนั้นไม่แตกต่างกันอย่างแน่นอน ความเสี่ยงของนาโนศาสตร์นั้นฟังดูน่ากลัวกว่าการวิจัยทางวิทยาศาสตร์อื่น ๆ เพราะพวกเขามักฟังดูเหมือนนิยายวิทยาศาสตร์มากกว่าความเป็นจริง ความเสี่ยงส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับนาโนศาสตร์นั้น ได้แก่ nanomachines ที่ไม่สามารถควบคุมได้ nanoweaponry และความเสี่ยงที่ไม่คาดคิดที่เลวร้ายที่สุด ไม่ว่าจะมีความเสี่ยงใด ๆ เหล่านี้ร้ายแรงหรือไม่
นาโนสเกลคือการศึกษาเครื่องจักรด้วยกล้องจุลทรรศน์แต่ละเครื่องมีความสามารถในการทำหน้าที่ในระดับเซลล์ระดับโมเลกุลหรือแม้แต่ระดับอะตอม นาโนสโคปสร้างเครื่องจักรขนาดเล็กเหล่านี้โดยมีเป้าหมายในการทำหน้าที่ที่น่าอัศจรรย์เกือบจะด้วยขั้นตอนมาตรฐาน Nanomachines มีศักยภาพที่จะทำการผ่าตัดที่ละเอียดอ่อนรักษาโรคที่ไม่หยุดยั้งก่อนหน้านี้แปลงขยะพิษให้เป็นวัสดุที่ไม่เป็นอันตรายและมีประโยชน์และสร้างเกือบทุกอย่างที่สามารถจินตนาการได้จากวัสดุพื้นฐาน ถ้ามันไปถึงศักยภาพอย่างเต็มที่นาโนศาสตร์อาจเปลี่ยนโลกด้วยวิธีที่ยอดเยี่ยมและยอดเยี่ยม
แน่นอนว่าด้วยศักยภาพมากมายที่จะทำสิ่งที่ดีได้นักนาโนศาสตร์ก็มีศักยภาพที่จะทำอันตรายอย่างมากมาย ความเสี่ยงที่เป็นไปได้ที่ถูกกล่าวถึงมากที่สุดมักถูกอ้างถึงอย่างง่าย ๆ ว่า Grey Goo เป้าหมายหลักของวิทยาศาสตร์นาโนคือการสร้างกล้องจุลทรรศน์นาโนสโคปซึ่งสามารถเปลี่ยนแปลงสิ่งต่าง ๆ ในระดับโมเลกุลหรืออะตอม เนื้อเยื่อมะเร็งในร่างกายของคน ๆ หนึ่งสามารถเปลี่ยนเป็นเนื้อเยื่อที่มีสุขภาพดีได้หรือเครื่องมือที่เป็นสนิมอาจถูกทำให้เป็นเหล็กเสียงอีกครั้ง
ความกลัวก็คือ nanomachines ที่ไม่มีการควบคุมสามารถวิ่งพล่านทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงที่ไม่ต้องการ แทนที่จะรักษาโรคมะเร็งพวกเขาอาจเปลี่ยนเซลล์ที่มีสุขภาพเป็นมะเร็ง แทนที่จะซ่อมเครื่องจักรที่ชำรุดพวกเขาอาจเปลี่ยนทุกอย่างให้กลายเป็นสารที่หนาสีเทา
ความเสี่ยงอีกอย่างหนึ่งของนาโนศาสตร์ก็คือผู้คนอาจลองเปลี่ยนนาโนมาเป็นอาวุธ เครื่องจักรขนาดเล็กเหล่านี้สามารถทำลายอาคารและเครื่องจักรเปลี่ยนอาหารให้เป็นพิษเครื่องใช้น้ำฉายรังสีตัดสายไฟหรือฆ่าคน ไม่มีการป้องกันมาตรฐานต่อ nanoweapons เหล่านี้จะมีประสิทธิภาพดังนั้นนาโนมาตรการตอบโต้จะต้องได้รับการพัฒนา วิทยาศาสตร์นาโนนั้นอันตรายเกินไปที่จะหันไปใช้กับการทำลายล้าง
บางทีความเสี่ยงที่อันตรายที่สุดของนาโนศาสตร์ก็คือสิ่งที่ยังไม่เข้าใจ เนื่องจากศาสตร์นาโนเป็นสาขาใหม่อาจมีความเสี่ยงที่ไม่คาดคิดที่ยังไม่ได้รับการสำรวจอย่างเต็มที่ มันเป็นสิ่งสำคัญที่โลกปฏิบัติต่อศาสตร์นาโนด้วยความเคารพและเอาใจใส่อย่างสูงสุด
ในขณะที่นาโนศาสตร์นั้นมีความเสี่ยงอย่างชัดเจนดังนั้นความพยายามทั้งหมดดังกล่าว ประโยชน์ที่เป็นไปได้ของวิทยาศาสตร์นาโนนั้นคุ้มค่าที่จะต้องพยายามอย่างหนักและพวกมันอาจจะเปลี่ยนโฉมหน้าของโลกได้ มันขึ้นอยู่กับพวกเราทุกคนเพื่อให้แน่ใจว่านาโนสเกลจะเปลี่ยนแปลงสิ่งต่าง ๆ ให้ดีขึ้นเท่านั้น


