การมีน้ำใต้ดินที่มีคุณภาพนั้นหมายถึงมากกว่าแค่การมีน้ำสะอาด มันคำนึงถึงปริมาณแร่ธาตุของน้ำเช่นกัน คุณภาพของน้ำใต้ดินถูกควบคุมโดยปัจจัยหลายอย่างรวมถึงมลพิษ แต่มีสามปัจจัยหลักที่มีผลต่อคุณภาพน้ำใต้ดิน: สภาพภูมิอากาศความลึกของน้ำและดินและตะกอน
ปัจจัยแรกคือสภาพภูมิอากาศของพื้นที่ ในพื้นที่ที่ร้อนกว่าซึ่งมีปริมาณฝนน้อยกว่าน้ำจะระเหยเร็วขึ้นเมื่ออยู่ใกล้พื้นผิวดิน น้ำระเหยอย่างรวดเร็วทิ้งแร่ธาตุไว้บนพื้น ในครั้งต่อไปที่ฝนตกและน้ำถูกแช่ลงในดินน้ำจะดูดซับแร่ธาตุและพาพวกเขาไปยังแหล่งน้ำทำให้รสชาติเค็ม พื้นที่ที่เย็นกว่าซึ่งมีปริมาณฝนตกมากจะมีปริมาณแร่ธาตุในน้ำน้อยลงทำให้คุณภาพน้ำใต้ดินดีขึ้น
ปัจจัยที่สองที่ควบคุมคุณภาพน้ำใต้ดินคือความลึกของน้ำใต้ดินจากพื้นผิว ระดับน้ำที่ลึกกว่าจะมองเห็นมลพิษน้อยลงเพราะเป็นเรื่องยากสำหรับมลพิษที่จะไปถึงน้ำ อย่างไรก็ตามน้ำที่ลึกกว่าจะมีปริมาณแร่ธาตุที่สูงกว่า น้ำทำงานเพื่อละลายสิ่งใดก็ตามที่สัมผัสกับมันดังนั้นเมื่อมันจมลึกลงไปในพื้นดินมันกำลังละลายแร่ธาตุและพาพวกมันไปทางน้ำ
แหล่งน้ำตื้นจะไม่เป็นแร่เพราะน้ำไม่ลงลึก อย่างไรก็ตามมันมีแคลเซียมเหล็กและแมกนีเซียมในระดับที่สูงขึ้นเนื่องจากดินไม่ได้มีเวลานานในการกำจัดออก สิ่งนี้ทำให้น้ำ "ยาก" น้ำตื้นก็มีโอกาสสูงที่จะได้รับผลกระทบจากการปนเปื้อน
ปัจจัยที่สามคือการควบคุมคุณภาพน้ำใต้ดินคือชนิดของดินและตะกอนในพื้นที่ ตะกอนบางประเภทมีสารเคมีและแร่ธาตุเช่นซัลเฟอร์ที่ละลายเร็วทำให้มีแร่ธาตุในน้ำสูงขึ้น ตะกอนชนิดอื่นมีเนื้อหาน้อยกว่าที่สามารถละลายได้ง่ายและนำไปสู่การประปา
อีกแง่มุมของคุณภาพน้ำใต้ดินที่ควบคุมโดยประเภทของดินคือความสามารถในการซึมผ่านของดิน ทรายที่มีความสามารถซึมผ่านได้สูงช่วยให้น้ำไหลผ่านได้ง่ายป้องกันไม่ให้น้ำเก็บแร่จำนวนมากในระหว่างทาง ดินที่ดูดซึมได้น้อยเช่นดินทำให้น้ำช้าลงทำให้มีโอกาสละลายแร่ธาตุได้มากขึ้น อย่างไรก็ตามเมื่อน้ำเคลื่อนผ่านพื้นอย่างช้าๆมีโอกาสที่ดีกว่าที่จะปล่อยสารมลพิษและสารปนเปื้อนอื่น ๆ ไว้ข้างหลังทำให้เกิดน้ำที่สะอาดขึ้น
