โปรตีนเบต้าอะไมลอยด์เป็นเปปไทด์ขนาดใหญ่ที่มีกรดอะมิโนระหว่าง 39 และ 43 ห่วงโซ่เปปไทด์นี้เป็นความคิดที่มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของโรคอัลไซเมอร์ โล่ที่พัฒนาขึ้นในสมองของคนที่เป็นโรคอัลไซเมอร์นั้นประกอบไปด้วยเบต้าอะไมลอยด์เปปไทด์เป็นหลัก เปปไทด์นี้อาจมีบทบาทในการพัฒนาโรคทางระบบประสาทอื่น ๆ เช่นภาวะสมองเสื่อมจากร่างกาย Lewy
แผ่นเบต้าอะไมลอยด์ส่วนใหญ่เกิดจากเปปไทด์ที่มีกรดอะมิโนยาว 42 ตัว รูปแบบทั่วไปของเปปไทด์นั้นมีกรดอะมิโนเพียง 40 ชนิด แต่เปปไทด์ 42AA นั้นมีแนวโน้มที่จะก่อตัวเป็นคราบ เนื้อเยื่อเกิดขึ้นเนื่องจากโปรตีนเป็น fibrillogenic ซึ่งหมายความว่ามันมีแนวโน้มที่จะรวมตัวกันกับโปรตีนชนิดอื่นเพื่อสร้างโครงสร้างเส้นใย โครงสร้างเหล่านี้เป็นโล่ที่ยับยั้งการทำงานของสมองปกติในผู้ที่เป็นโรคอัลไซเมอร์
การวิจัยแสดงให้เห็นว่าโล่ทำให้เกิดภาวะสมองเสื่อมเนื่องจากกลุ่มเส้นใยของเปปไทด์เหล่านี้ยึดติดกับเซลล์ประสาทในสมอง เส้นใยจะป้องกันเซลล์ประสาทไม่ให้รับสัญญาณจากเซลล์อื่น ๆ ในสมอง เซลล์ประสาทที่ได้รับผลกระทบไม่สามารถทำงานหรือสื่อสารกับเซลล์สมองอื่นและตายไป
สมองเสื่อมนั้นได้รับการถ่ายทอดทางพันธุกรรมบางส่วนซึ่งเป็นลักษณะที่สัมพันธ์กับแนวโน้มที่จะผลิตเปปไทด์อะไมลอยด์เบต้าที่มีกรดอะมิโนยาว 42 ตัว เมื่อบุคคลมียีนหนึ่งสำเนาซึ่งผลิตเปปไทด์ 42AA เขาหรือเธอมีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นในการพัฒนาโรคอัลไซเมอร์ คนที่มียีนสองชุดนี้มีความเสี่ยงสูงในการพัฒนาโรคอัลเซเมอร์
จากความรู้นี้ว่าโปรตีนมีปฏิกิริยาต่อการก่อตัวของเนื้อเยื่อได้อย่างไรนักวิจัยได้มีความคิดหลายอย่างที่อยู่ภายใต้การตรวจสอบว่าเป็นการบำบัดที่มีศักยภาพในการรักษาโรคอัลไซเมอร์ หนึ่งในนั้นคือเอนไซม์ที่เรียกว่า beta-secretase inhibitor เอ็นไซม์นี้อาจยับยั้งการแยกโปรตีนอะไมลอยด์ในรูปแบบ 42AA ซึ่งเกี่ยวข้องอย่างมากกับการพัฒนาของอัลไซเมอร์ แนวคิดที่เกี่ยวข้องคือเอนไซม์ gamma-secretase ซึ่งป้องกันการก่อตัวของเปปไทด์ 42AA ที่จุดอื่นในวงจรการผลิต
อีกวิธีหนึ่งในการรักษาโรคอัลไซเมอร์คือการพัฒนาแอนติบอดี้เบต้าแอมีลอยด์ซึ่งสามารถจดจำและเชื่อมโยงกับเปปไทด์ 42AA แอนติบอดีเหล่านี้อาจจะสามารถจับกับเปปไทด์และป้องกันไม่ให้กลายเป็นโล่ นอกจากนี้แอนติบอดียังช่วยส่งเสริมการทำลายของเปปไทด์เนื่องจากระบบภูมิคุ้มกันจะทำลายคอมเพล็กซ์แอนติบอดี้ - เปปไทด์ที่ก่อตัวขึ้น
