เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพเป็นภาชนะที่ใช้กักสิ่งมีชีวิตเพื่อควบคุมกระบวนการทางชีวเคมีตามธรรมชาติ ตัวอย่างที่เรียบง่ายและเป็นที่รู้จักกันดีของถังปฏิกรณ์ชีวภาพคือถังหมักสำหรับเบียร์ซึ่งจุลินทรีย์บางชนิดได้รับการส่งเสริมให้เจริญเติบโตทำให้เนื้อหาของถังหมักและสร้างผลิตภัณฑ์ที่ใช้งานได้ มีเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพหลายประเภทและใช้เพื่อวัตถุประสงค์ที่หลากหลายตั้งแต่การแปรรูปขยะมูลฝอยจนถึงการผลิตยา
ในเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพแบบแบตช์ทุกอย่างจะถูกเพิ่มเข้าไปในสภาพแวดล้อมที่ถูกควบคุมและปิดผนึกทันทีและปฏิกิริยาชีวเคมีได้รับอนุญาตให้ดำเนินการก่อนที่จะเปิดเครื่องปฏิกรณ์เพื่อให้สามารถสกัดและนำไปใช้กำจัดหรือกำจัดกระบวนการ คนอื่น ๆ ใช้วิธีการไหลแบบต่อเนื่องซึ่งวัสดุจะไหลผ่านเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพอย่างต่อเนื่อง ตัวอย่างเช่นระบบบำบัดของเสียใช้การไหลอย่างต่อเนื่องเพื่อประมวลผลขยะ
จำนวนของเกณฑ์ต้องเป็นที่พอใจเมื่อสร้างเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพ เพื่อให้อุปกรณ์มีประสิทธิภาพเงื่อนไขจะต้องมีการควบคุมอย่างเข้มงวดซึ่งหมายความว่าจะต้องมีวิธีในการควบคุมอุณหภูมิระดับแสงความชื้นออกซิเจนและองค์ประกอบอื่น ๆ ของสภาพแวดล้อม นอกจากนี้ยังเป็นสิ่งสำคัญที่จะแยกเนื้อหาจากสารปนเปื้อนเพื่อให้เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพทำงานได้อย่างถูกต้องและเพื่อไม่ให้เกิดอาการไม่พึงประสงค์ ยกตัวอย่างเช่นในเบียร์การแนะนำของจุลินทรีย์ที่ไม่ถูกต้องอาจทำให้เบียร์มีรสเปรี้ยว
การเปลี่ยนขยะอินทรีย์เช่นปุ๋ยหมักหรือขยะมูลฝอยเป็นโปรแกรมประยุกต์ทั่วไปสำหรับเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพ เมื่อสร้างอย่างเหมาะสมเครื่องปฏิกรณ์สามารถเพิ่มความเร็วในกระบวนการสลายได้อย่างมากซึ่งก่อให้เกิดประสิทธิภาพโดยรวม เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพยังใช้เพื่อส่งเสริมการเจริญเติบโตเช่นในการผลิตของวัฒนธรรมเนื้อเยื่อหรือการเพาะปลูกเชื้อราเฉพาะที่ใช้ในยา ในบางกรณีอาจจำเป็นต้องกำหนดอุปกรณ์ที่กำหนดเองเพื่อตอบสนองความต้องการเฉพาะของแอปพลิเคชันเฉพาะซึ่งในกรณีนี้จำเป็นต้องใช้ทักษะของนักชีวเคมีโดยทั่วไป
นักวิจัยกำลังคิดค้นการใช้งานใหม่สำหรับเทคโนโลยีเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพอย่างต่อเนื่อง ตัวอย่างเช่นอุปกรณ์เหล่านี้อาจถูกนำมาใช้เพื่อผลิตพลังงานหรือเพื่อปลูกเนื้อเยื่อและการปลูกถ่ายอวัยวะ การผลิตสารเคมีสามารถพึ่งพาเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพได้มากขึ้นอยู่กับสารประกอบที่กำลังผลิตเช่นเดียวกับการประมวลผลขนาดใหญ่ของปุ๋ยหมักและขยะมูลฝอยในเขตเทศบาล การทดลองจำนวนมากยังได้ดำเนินการกับเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพในสภาพแวดล้อมที่ท้าทายเช่นพื้นที่เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับกระบวนการทางชีวเคมีและเพื่อสร้างข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ที่เป็นประโยชน์
