จีโนมของจุลินทรีย์เป็นลำดับที่สมบูรณ์ของรหัสพันธุกรรมของจุลินทรีย์ที่กำหนด ขนาดของจีโนมในจุลินทรีย์สามารถแตกต่างกันมาก ขนาดของสิ่งมีชีวิตที่เสร็จแล้วไม่จำเป็นต้องมีขนาดเท่ากับรหัสพันธุกรรมของมัน จุลินทรีย์มีมาเป็นเวลานานมากและเป็นผลให้หลายคนมีจีโนมขนาดใหญ่และซับซ้อนมากซึ่งมีข้อมูลทางประวัติศาสตร์และพันธุกรรมที่น่าสนใจ
จุลินทรีย์หรือที่เรียกว่าจุลินทรีย์เป็นสิ่งมีชีวิตที่มีขนาดเล็กมากจนสามารถมองเห็นได้ด้วยความช่วยเหลือของกล้องจุลทรรศน์ ตัวอย่างของจุลินทรีย์ ได้แก่ สาหร่ายสีเขียวแบคทีเรียโปรติสต์อาร์เคียแพลงก์ตอนและราบางชนิด สิ่งมีชีวิตเหล่านี้มีความซับซ้อนแตกต่างกันไปอย่างมากจากสิ่งมีชีวิตที่เรียบง่ายที่สุดไปจนถึงสิ่งอื่นที่ซับซ้อน จุลินทรีย์สามารถพบได้ทุกที่และพวกมันมีหน้าที่ทางชีววิทยาที่สำคัญมากมายตั้งแต่การเข้าร่วมในการสลายสารอินทรีย์จนถึงการเป็นตัวแทนของโรค
จีโนมเป็นชุดที่สมบูรณ์ของสารพันธุกรรมของสิ่งมีชีวิตใด ๆ ในกรณีของจีโนมของจุลินทรีย์มันประกอบด้วยชุดข้อมูลทางพันธุกรรมที่เรียงลำดับอย่างสมบูรณ์จากจุลินทรีย์ โดยการเรียงลำดับจีโนมของจุลินทรีย์อย่างสมบูรณ์นักวิจัยสามารถเรียนรู้มากขึ้นเกี่ยวกับจุลินทรีย์และสิ่งที่มันทำ ตัวอย่างเช่นพวกเขาอาจสามารถติดตามประวัติวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิตและเพื่อดูว่ามันและคนอื่น ๆ แยกออกจากบรรพบุรุษร่วมกัน ในทำนองเดียวกันนักวิจัยสามารถเริ่มเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับหน้าที่เฉพาะของลำดับดีเอ็นเอบางอย่างเพื่อค้นหาว่าส่วนใดของจีโนมทำอะไร
สำหรับแบคทีเรียการเรียงลำดับจีโนมของจุลินทรีย์นั้นซับซ้อนโดยข้อเท็จจริงที่ว่าแบคทีเรียจำนวนมากมีพลาสมิด พลาสมิดเป็นส่วนของ DNA ที่ไม่ได้อยู่ในโครโมโซม DNA extrachromosomal นี้สามารถแลกเปลี่ยนระหว่างแบคทีเรียและบางครั้งอาจรวมอยู่ในจีโนมของจุลินทรีย์ขึ้นอยู่กับสิ่งมีชีวิตที่เกี่ยวข้องและสิ่งแวดล้อมกดดันใบหน้า การวิเคราะห์จีโนมของแบคทีเรียสามารถรวมการวิเคราะห์แยกเพื่อระบุพลาสมิด
ห้องปฏิบัติการหลายแห่งทั่วโลกทำการวิจัยเกี่ยวกับจีโนมของจุลินทรีย์ รัฐบาลหลายแห่งได้จัดทำโครงการลำดับยีนที่ออกแบบมาเพื่อพัฒนาความรู้เกี่ยวกับจีโนมของจุลินทรีย์ส่วนหนึ่งโดยมีเป้าหมายในการพัฒนาการใช้งานทางวิทยาศาสตร์สำหรับจุลินทรีย์ ยกตัวอย่างเช่นการเรียงลำดับของแบคทีเรียบางตัวได้เปิดเผยว่าพวกมันอาจเป็นประโยชน์ในการทำความสะอาดสิ่งแวดล้อมในขณะที่ความเข้าใจในการทำงานของพลาสมิดทำให้เกิดการใช้พลาสมิดที่ดัดแปลงพันธุกรรมซึ่งสามารถนำมาใช้ในการใส่สารพันธุกรรมลงในสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ
