เพื่อวัตถุประสงค์ในการนิยามคำว่ายลเยื่อหุ้มเซลล์อาจหมายถึงเยื่อหุ้มด้านในหรือด้านนอกของเซลล์ยลขึ้นอยู่กับบริบทที่ใช้คำนี้ ดังนั้นเยื่อหุ้มเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับไมโตคอนเดรียจะถูกระบุว่าเป็นเยื่อหุ้มยล ภายใน หรือ ภายนอก ยล เยื่อหุ้มชั้นนอกของไมโทคอนเดรียนนั้นเรียบและล้อมรอบทั้งออร์แกเนลล์ เยื่อหุ้มสมองส่วนในนั้นก่อตัวเป็น cristae ซึ่งเป็นทางเดินที่บิดและบิดคล้ายกับสมอง
เพื่อทำความเข้าใจเกี่ยวกับเยื่อหุ้มเซลล์ยลจำเป็นอย่างยิ่งที่จะต้องเข้าใจยูคาริโอตก่อนและโครงสร้างของเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับไมโตคอนเดรีย สิ่งมีชีวิตที่มีโครงสร้างเซลลูลาร์ที่ซับซ้อนและประกอบด้วยเยื่อหุ้มเซลล์รวมถึงพืชสัตว์และมนุษย์เรียกว่ายูคาริโอต ยูคาริโอตที่ขึ้นกับออกซิเจนทั้งหมดมีไมโตคอนเดรีย ไมโตคอนเดรียปรากฏในแต่ละเซลล์ของยูคาริโอตและมีหน้าที่ผลิตอะดีโนซีนไตรฟอสเฟต (ATP) ซึ่งเป็นแหล่งพลังงานเคมีที่ได้จากออกซิเจนและสารอาหารต่าง ๆ
ภายใต้การขยายกำลังแรงสูงไมโตคอนเดรียปรากฏเป็นรูปวงรีหรือเป็นรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้ามีเมมเบรนสองชั้นและพื้นที่ด้านในซึ่งเรียกว่าเมทริกซ์ มีไมโตคอนเดรียจำนวนมากอยู่ในเซลล์เดียวโดยมีรูปร่างและขนาดที่แน่นอนขึ้นอยู่กับประเภทของเซลล์ที่เฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ไมโตคอนเดรียของสิ่งมีชีวิตหนึ่งยังมีลักษณะที่แตกต่างจากสิ่งมีชีวิตอื่น
มันเป็นหน้าที่ของไมโตคอนเดรียในการหายใจแอโรบิกกระบวนการเปลี่ยนออกซิเจนและสารอาหารให้เป็นเอทีพี กระบวนการนี้เกิดขึ้นตามเยื่อหุ้ม cristae หรือเยื่อหุ้มยลภายในโดยใช้เอ็นไซม์ที่ฝังอยู่ในเมมเบรนและโปรตีนจากเมทริกซ์ เมื่อมีการผลิต ATP เซลล์จะใช้สารเคมีเป็นแหล่งพลังงานเพื่อเปิดใช้งานการเคลื่อนที่ของเซลล์การแบ่งเซลล์และฟังก์ชั่นการเผาผลาญอื่น ๆ
ในขณะที่เมมเบรนยลไมโตคอนเดรียช่วยในการผลิตเอทีพีเมมเบรนยลไมโตคอนเดรียด้านนอกทำหน้าที่เป็นตัวกรอง การใช้โปรตีนที่เรียกว่า porin เมมเบรนชั้นนอกจะสร้างช่องทางที่อนุญาตให้โมเลกุลที่มีขนาดบางขนาดเข้าสู่ไมโทคอนเดรียเท่านั้น เมื่อเข้าไปข้างในโมเลกุลจะถูกกรองเพิ่มเติมโดยเยื่อหุ้มชั้นใน เฉพาะโมเลกุลที่ถูกกำหนดล่วงหน้าว่ามีความสำคัญต่อการผลิต ATP เท่านั้นที่ได้รับอนุญาตให้ผ่านเยื่อหุ้มชั้นใน
เยื่อหุ้มไมโตคอนเดรียทั้งภายในและภายนอกมีจุดประสงค์สำคัญในการทำงานโดยรวมของไมโตคอนเดรีย แม้ว่าทั้งสองจะตอบสนองวัตถุประสงค์ แต่กิจกรรมส่วนใหญ่ของออร์แกเนลล์เกี่ยวข้องกับเยื่อหุ้มยลภายในและเมทริกซ์ เมื่อพิจารณาเปรียบเทียบขนาดคริสเตนั้นมีขนาดใหญ่กว่าเมมเบรนด้านนอกเนื่องจากเป็นธรรมชาติที่บิดเบี้ยวและซับซ้อน ด้วยพื้นที่ผิวขนาดใหญ่ของคริสเตนั้นไมโทคอนเดรียนแต่ละตัวสามารถจัดเอ็นไซม์ที่จำเป็นในการสร้างเอทีพีได้มากขึ้นจึงส่งมอบเซลล์ที่มีพลังงานมากขึ้นเพื่อทำงาน
