แอนติเจนเปปไทด์คือการใช้เปปไทด์เพื่อกระตุ้นระบบภูมิคุ้มกันของสัตว์ในการพัฒนาแอนติบอดี้ไปยังเปปไทด์ เปปไทด์เป็นกรดอะมิโนจำนวนสั้น ๆ โซ่อีกต่อไปเป็นที่รู้จักกันในนามโปรตีน แอนติเจนเปปไทด์อาจถูกนำมาใช้เป็นส่วนหนึ่งของการพัฒนาวัคซีน
เปปไทด์เป็นโมเลกุลอินทรีย์ประกอบด้วยไนโตรเจนออกซิเจนคาร์บอนไฮโดรเจนและกำมะถัน พวกเขาเป็นโซ่ของกรดอะมิโนและเชื่อมโยงกันด้วยพันธะเปปไทด์ พันธะเปปไทด์เป็นการเชื่อมโยงของกลุ่ม NH2 และ COOH ของกรดอะมิโนสองตัวที่อยู่ติดกัน
แอนติเจนเป็นโมเลกุลที่จับกับแอนติบอดีและสร้างการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันปฏิกิริยาของร่างกายต่อโมเลกุลที่ดูเหมือนจะแปลกปลอม โมเลกุลทุกชนิดนั้นไม่สามารถรับรู้ได้จากระบบภูมิคุ้มกัน โปรตีนเปปไทด์และสายโซ่ของน้ำตาลสามารถทำหน้าที่เป็นแอนติเจน
นอกจากนี้ยังมีแอนติเจนของมนุษย์ เหล่านี้รวมถึงโปรตีนที่มีอยู่บนพื้นผิวของเซลล์มะเร็ง แอนติเจนดังกล่าวยังสามารถพบได้ในเลือด นี่คือพื้นฐานที่อยู่เบื้องหลังการตรวจหาแอนติเจนจำเพาะของการนอนกรนซึ่งมักใช้ในการคัดกรองโรคมะเร็งกราบ แอนติเจนบางตัวได้รับการแนะนำให้ทำหน้าที่เป็นวัคซีนและสร้างการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน
แอนติบอดีเป็นโปรตีนในเลือดที่ต่อต้านแอนติเจนที่จำเพาะ แอนติบอดีมีเพียงโมเลกุลบางส่วนเท่านั้น ส่วนปลายของแอนติบอดีมี Paratope ที่รับรู้ถึงโครงสร้างที่ซับซ้อนของแอนติเจน แอนติบอดี้นี้มีหน้าที่รับผิดชอบต่อความหลากหลายของแอนติบอดี้ที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิต บุคคลหนึ่งคนสามารถมีแอนติบอดีที่แตกต่างกันนับล้าน
บ่อยครั้งที่มีการใช้แอนติเจนของเปปไทด์เนื่องจากเป็นส่วนหนึ่งของโปรตีนที่มีขนาดใหญ่กว่าซึ่งอาจไม่ได้รับการทำให้บริสุทธิ์ เมื่อใช้เปปไทด์แอนติเจนในการสร้างแอนติบอดีเป็นสิ่งสำคัญที่นักวิจัยใช้ส่วนแอนติเจนของเปปไทด์ ผู้เชี่ยวชาญด้านแอนติเจนสามารถช่วยในการออกแบบแอนติเจนเพื่อเพิ่มโอกาสที่เปปไทด์ที่ใช้เป็นแอนติเจนจะสร้างแอนติบอดี มันง่ายกว่ามากในการทำนายว่า epitopes ใดถูกเปิดเผยหากมีความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างสามมิติของสารประกอบ
ในกรณีส่วนใหญ่ไม่มีความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างโดยรวมของเปปไทด์ถึงแม้ว่าซอฟต์แวร์ทำนายผลสามารถวิเคราะห์ได้ว่าส่วนใดของเปปไทด์ที่น่าจะเป็นแอนติเจน เปปไทด์ที่มีแนวโน้มจะพบแอนติบอดีมากที่สุดคือที่ผิวของเซลล์ มีแนวโน้มว่าจะละลายในน้ำได้ ความยืดหยุ่นยังเป็นเกณฑ์สำคัญสำหรับแอนติเจนของเปปไทด์ในการทำปฏิกิริยากับ epitope
เมื่อมีการระบุแอนติเจนของเปปไทด์ที่เหมาะสมจะมีการสร้างเปปไทด์สังเคราะห์ขึ้น มันสามารถใช้ในการสร้างภูมิคุ้มกัน มันถูกฉีดเข้าไปในสัตว์เพื่อสร้างการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน เมื่อแยกแอนติบอดีพวกมันจะถูกวิเคราะห์เพื่อให้แน่ใจว่าสิ่งมีชีวิตนั้นได้รับการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันอย่างมีประสิทธิภาพ
วิธีทดสอบทั่วไปวิธีหนึ่งเพื่อดูว่าแอนติบอดีมีความเฉพาะเจาะจงสำหรับโปรตีนที่ต้องการหรือไม่ สิ่งนี้เกี่ยวข้องกับการแยกโปรตีนที่มีเปปไทด์บนเจลโดยใช้กระแสไฟฟ้า นี่เรียกว่าอิเล็กโตรโฟรีซิส จากนั้นโปรตีนจะถูกถ่ายโอนไปยังเมมเบรนและตรวจสอบด้วยแอนติบอดี
หากมีแอนติบอดีจำเพาะสำหรับโปรตีนมันจะจับกับโปรตีนในเมมเบรน เมมเบรนจะถูกชะล้างและผ่านการบำบัดด้วยแอนติบอดีทุติยภูมิ ถ้าแอนติบอดีถูกพัฒนาในหนูตัวอย่างแอนติบอดีรองจะเป็นแอนติบอดีต่อต้านเมาส์ แอนติบอดีนี้ถูกออกแบบมาเพื่อสร้างสีหรือการเรืองแสงเพื่อให้นักวิจัยสามารถดูที่แอนติบอดีเดิมมีผลผูกพัน
