ลำดับของเปปไทด์คืออะไร?

เปปไทด์เป็นโพลิเมอร์ชีวภาพที่เกิดจากการเชื่อมโยงของกรดอะมิโนองค์ประกอบสำคัญคือคาร์บอน (C) ไฮโดรเจน (H) ออกซิเจน (O) และไนโตรเจน (N) คำว่า "ลำดับเปปไทด์" หมายถึงลำดับที่กรดอะมิโนเชื่อมโยงกัน เปปไทด์มีความสำคัญมากในระบบสิ่งมีชีวิตและรวมตัวกันเป็นโซ่ที่ใหญ่กว่าเรียกว่าโปรตีน แม้ว่าจะมีเปปไทด์ชีวภาพหลายชนิด แต่ส่วนใหญ่ผลิตจากกรดอะมิโนเพียง 20 ชนิด โปรตีนทำหน้าที่หลากหลายทางชีวภาพรวมถึงเป็นเอนไซม์และในโครงสร้างของผนังเซลล์ในพืชและเยื่อหุ้มเซลล์สัตว์

กรดอะมิโนถูกเรียกเช่นนั้นเพราะมีเอมีน (-NH 2 ) และกรดคาร์บอกซิลิก (-CO 2 H) กรดอะมิโนส่วนใหญ่ที่พบในระบบทางชีวภาพนั้นมีสูตรทั่วไป R-CH (NH 2 ) -CO 2 H ซึ่ง R คือช่วงของกลุ่ม โครงสร้างที่แตกต่างของ R คือสิ่งที่มีอิทธิพลต่อโครงสร้างและคุณสมบัติของเปปไทด์และโปรตีน

การสังเคราะห์เปปไทด์เกิดขึ้นเมื่อกรดอะมิโนกลุ่มหนึ่งทำปฏิกิริยากับกลุ่มกรดคาร์บอกซิลิกในกรดอะมิโนตัวอื่น ผลที่ได้คือการก่อตัวของกลุ่มโครงสร้างอะไมด์ -N (H) -CO- โดยพันธะไนโตรเจนต่อคาร์บอนเรียกว่าพันธะเปปไทด์ ปฏิกิริยาสามารถเกิดขึ้นได้หลายครั้งในการสร้างลำดับเปปไทด์ของกลุ่มการทำงานที่แตกต่างกันซึ่งแต่ละกลุ่มจะถูกสลับโดยกลุ่มเอไมด์

เปปไทด์และโปรตีนมีโครงสร้างในระดับต่างกัน โครงสร้างโปรตีนหลักคือลำดับที่พบกรดอะมิโน นี่คือลำดับเปปไทด์ของมัน กลุ่มการทำงานของโปรตีนมีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกันเพื่อดึงให้เป็นรูปร่าง การบิดและเปปไทด์แต่ละครั้งเรียกว่าโครงสร้างรอง รูปร่างโดยรวมของมันผลสุทธิของการบิดและการหมุนทั้งหมดเหล่านี้คือโครงสร้างระดับอุดมศึกษาของเปปไทด์

คุณสมบัติทางชีวเคมีของโปรตีนหรือเปปไทด์ขึ้นอยู่กับโครงสร้างของตติยภูมิ เช่นเดียวกับสารเคมีทั้งหมดโปรตีนจะถือว่ามีรูปร่างที่ดีที่สุดที่มีพลัง รูปร่างนี้เป็นเพราะพลังที่น่าดึงดูดและน่ารังเกียจระหว่างกลุ่มในกรดอะมิโนแต่ละตัว ดังนั้นโครงสร้างระดับอุดมศึกษาเป็นเพราะโครงสร้างหลักซึ่งหมายความว่าการลดลำดับของเปปไทด์ของโปรตีนนั้นจะอธิบายคุณสมบัติในท้ายที่สุด

การหาลำดับของเปปไทด์ของโปรตีนมีการประยุกต์ใช้ในการออกแบบยา กระบวนการทางชีวภาพหลายอย่างขึ้นอยู่กับการกระทำของโปรตีนและยามักจะทำงานโดยการคัดลอกหรือปิดกั้นการกระทำของโปรตีนเหล่านี้ การทำความเข้าใจพฤติกรรมของโปรตีนอาจนำไปสู่การออกแบบยาที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น ด้วยเหตุนี้แผนกวิจัยและพัฒนาของ บริษัท ยามักจะมีห้องสมุดเปปไทด์หรือแคตตาล็อกเปปไทด์ที่จะใช้ในการค้นหายาใหม่