จีโนมของพืชคือลำดับของ DNA ที่ให้ข้อมูลสำหรับพืชที่จะมีชีวิต ภายในสิ่งมีชีวิตทั้งหมดจีโนมถูกสร้างขึ้นจากวัสดุทางพันธุกรรมสำหรับสิ่งมีชีวิตนั้น โมเลกุลดีเอ็นเอจะถูกจัดกลุ่มเป็นยีนที่ให้คำแนะนำที่กำหนดสิ่งที่พืชทำสีรูปร่างและขนาดของมันที่ไหนและอย่างไรมันเติบโต ฯลฯ สิ่งมีชีวิตทุกคนมีจีโนมที่ประกอบด้วยยีนทั้งหมดที่กำหนด สิ่งมีชีวิตนั่นคืออะไร
จีโนมทุกชนิดรวมถึงจีโนมของพืชประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ที่ประกอบกันเป็น DNA ของสิ่งมีชีวิตนั้น นิวคลีโอไทด์มีอยู่สี่ชนิดที่พบภายใน DNA ได้แก่ อะลานีน (A) ไทมีน (T) กัวนีน (G) และไซโตซีน (C) สายของนิวคลีโอไทด์อาจมีความยาวมากและคำสั่งของพวกมันคือสิ่งที่ทำให้เกิดยีนขึ้นมา แทนที่จะเป็นสายยาวหนึ่ง DNA, ยีนจะถูกจัดกลุ่มในโครโมโซมที่พบภายในนิวเคลียสของทุกเซลล์ของสิ่งมีชีวิต เช่นเดียวกับการมียีนที่แตกต่างกันสิ่งมีชีวิตชนิดต่าง ๆ ก็มีโครโมโซมต่างกัน
การศึกษาจีโนมได้ดำเนินการโดยนักวิทยาศาสตร์มาหลายปีแล้ว นักพันธุศาสตร์พยายามค้นหายีนที่เป็นรหัสสำหรับลักษณะเฉพาะและหน้าที่ของสิ่งมีชีวิต จนกระทั่งเมื่อไม่นานมานี้พวกเขาถูก จำกัด ในสิ่งที่พวกเขาสามารถหาได้ แต่ตอนนี้พวกเขาได้พัฒนาวิธีการหรือค้นหาลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งหมดที่ประกอบกันเป็นจีโนม ในการจัดลำดับจีโนมของพืชนักวิทยาศาสตร์จะต้องตรวจสอบนิวคลีโอไทด์ทุกอันที่พบในโครโมโซมของพืชที่กำลังศึกษาอยู่
การหาลำดับของจีโนมของพืชนั้นไม่ใช่เรื่องง่ายเนื่องจากพืชหลากหลายชนิดรวมถึงจีโนมที่แตกต่างกันมาก ช่วงจีโนมของพืชมีขนาดแตกต่างกันไปจากสปีชีส์ที่มีจีโนมที่มีขนาดเล็กเท่ากับสัตว์เล็กจนถึงพืชอื่น ๆ ที่มีจีโนมที่มีขนาดเกือบสี่สิบเท่าของจีโนมมนุษย์ จีโนมของพืชแรกที่จะถูกจัดลำดับอย่างสมบูรณ์คือพืช Arabidopsis ซึ่งเป็นพืชเครสต์ขนาดเล็กที่เป็นส่วนหนึ่งของตระกูลมัสตาร์ด พืชชนิดนี้ได้รับเลือกเนื่องจากมีจีโนมที่ค่อนข้างสั้นเมื่อเปรียบเทียบกับพืชชนิดอื่น การหาลำดับเบสของ Arabidopsis พบว่ามี 25,000 ยีนซึ่งตอนนี้ถูกใช้เพื่อช่วยในการหาลำดับจีโนมของพืชที่มีจีโนมที่ซับซ้อนและยาวนานกว่ามาก
