พลาสมิดเป็น DNA ชิ้นส่วนวงกลมที่พบในแบคทีเรียหลายชนิด คุณสมบัติที่โดดเด่นที่สุดของพลาสมิดคือพวกมันทำซ้ำอย่างอิสระจากดีเอ็นเอหลักของโฮสต์ บ่อยครั้งที่มีการใช้พลาสมิดในเทคโนโลยีการโคลนนิ่ง recombinant เพื่อโคลนยีนที่แยกได้ใหม่ มันเป็นเรื่องธรรมดามากที่จะใช้ recombinant plasmid เพื่อแสดงยีนจำนวนมากที่รู้จักเพื่อรับ RNA หรือโปรตีนจากมัน การแสดงออกของยีนรีคอมบิแนนท์ดังกล่าวเป็นสิ่งที่ขาดไม่ได้สำหรับอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ
Recombinant plasmids ได้รับการพัฒนาเป็นครั้งแรกในหนูทดลองของโลกแบคทีเรีย Escherichia coli แบคทีเรียชนิดอื่น ๆ อีกมากมายสามารถปิดบังพลาสมิด บิตของการจำลองตัวเองเหล่านี้สามารถถ่ายโอนได้ตามธรรมชาติระหว่างแบคทีเรียชนิดต่าง ๆ อย่างไรก็ตามเรื่องนี้บางครั้งก็ยากที่จะแนะนำพลาสมิดรีคอมบิแนนท์ให้กับแบคทีเรียชนิดอื่น
ขั้นตอนหลักสำหรับการแนะนำ DNA เข้าสู่เซลล์อื่น ๆ เรียกว่าการแปลงสภาพซึ่งแบคทีเรียได้รับการรักษาด้วยสารเคมีที่ทำให้พวกเขามีแนวโน้มที่จะรับ DNA จากต่างประเทศ อีกเทคนิคหนึ่งที่เกี่ยวข้องกับการทำให้แบคทีเรียตกตะลึงด้วยกระแสไฟฟ้า เรื่องนี้เป็นที่รู้จักกันในชื่อ electroporation
เหตุผลในการสร้าง recombinant พลาสมิดแตกต่างกันไป บ่อยครั้งที่ดีเอ็นเอถูกแยกออกจากเนื้อเยื่อหรือสิ่งมีชีวิตเป็นครั้งแรกมันจะถูกเปลี่ยนเป็นพลาสมิดเพื่อสร้างห้องสมุด จากนั้น DNA สามารถสกัดได้จากแต่ละอาณานิคม จากนั้นสามารถคัดกรองด้วยลำดับดีเอ็นเอเพื่อกำหนดประเภทของยีนที่มีอยู่หากมีลำดับอยู่ในฐานข้อมูล บางครั้งมีการโคลนยีนที่มีฟังก์ชั่นที่ไม่รู้จัก
ในกรณีอื่น ๆ ผลิตภัณฑ์ยีนเป็นที่รู้จักกันดี แต่นักวิจัยต้องการแสดงจำนวนมากเพื่อการศึกษาต่อไป ยีนสามารถถูกโคลนเข้าไปในพลาสมิดของ recombinant ที่เป็นพาหะนำโรค พวกเขาถูกออกแบบมาโดยเฉพาะเพื่อผลิต RNA หรือโปรตีนจำนวนมาก สิ่งนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งสำหรับโปรตีนของมนุษย์ที่ recombinant ซึ่งก่อนหน้านี้มักจะหาได้จากศพเท่านั้นจึงยากที่จะศึกษาการทำงานของยีนจำเพาะ
มีหลายปัจจัยที่เกี่ยวข้องในการสร้างพลาสมิดที่สามารถใช้ในการโคลนโมเลกุล พลาสมิดจะต้องมีเครื่องหมายที่เลือกได้ ทำให้สามารถเลือกเซลล์ที่มียีนได้ โดยปกติประชากรของเซลล์ที่ขาดยีนที่มีเครื่องหมายจำนวนมากของจำนวนเซลล์ที่ดำเนินการ โดยทั่วไป recombinant พลาสมิดมีความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะหรือสามารถเจริญเติบโตได้ในกรณีที่ไม่มีกรดอะมิโนโดยเฉพาะ
พลาสมิดเช่นนี้ต้องการต้นกำเนิดของการจำลองแบบเพื่อให้สามารถเริ่มสังเคราะห์ดีเอ็นเอรีคอมบิแนนท์ได้ นอกจากนี้รีคอมบิแนนท์พลาสมิดจำเป็นต้องมีชุดของลำดับพิเศษเพื่อให้เอนไซม์ที่มีข้อ จำกัด ในการตัดดีเอ็นเอเพื่อให้ยีนถูกแทรกเข้าไปในเวกเตอร์โคลน มีเอนไซม์ จำกัด จำนวนมากที่มีความเชี่ยวชาญเป็นพิเศษสำหรับลำดับดีเอ็นเอที่เฉพาะเจาะจงซึ่งจะต้องมีอยู่ที่ยีนเริ่มต้นและสิ้นสุด
แบคทีเรียสายพันธุ์ดั้งเดิมถูกนำมาใช้ในการโคลนดีเอ็นเอมานานหลายทศวรรษ นอกจากนี้ยังมีชุดใหม่ที่ใช้สายพันธุ์แบคทีเรียที่สร้างขึ้นเป็นพิเศษเพื่ออำนวยความสะดวกในการแสดงออกของผลิตภัณฑ์ยีน พวกเขารวมเทคโนโลยีการโคลนยีนเข้ากับวิธีการที่ช่วยให้การทำให้บริสุทธิ์โปรตีนที่แสดงออกจากยีนนั้นง่ายขึ้นเมื่อถูกโคลนเข้าสู่พลาสมิดของ recombinant
