Transcriptome คืออะไร

Transcriptome เป็นชุดที่สมบูรณ์ของ RNA จากสิ่งมีชีวิตกลุ่มของเซลล์หรือแม้แต่เซลล์ที่เฉพาะเจาะจง RNA ถูกสังเคราะห์จาก DNA ผ่านกระบวนการที่เรียกว่าการถอดความ RNA ที่อยู่ในเซลล์และร่างกายจะเป็นตัวกำหนดยีนที่จะแสดงออกและมันเปลี่ยนไปตามวิถีชีวิตของสิ่งมีชีวิตซึ่งแตกต่างจาก DNA ซึ่งยังคงอยู่ แรงกดดันด้านสิ่งแวดล้อมเป็นหนึ่งในสาเหตุสำคัญของการเปลี่ยนแปลงเนื่องจากร่างกายพยายามปรับตัวให้เข้ากับสภาพแวดล้อมที่เปลี่ยนแปลงเพื่อให้ตัวเองทำงานได้

Transcriptome นั้นมีขนาดเล็กกว่าจีโนมของสิ่งมีชีวิตซึ่งเป็นการรวบรวม DNA ที่สมบูรณ์ในสิ่งมีชีวิต กล่าวง่ายๆว่าใคร ๆ ก็นึกถึง DNA ในฐานะตำราทำอาหารทำรายการคอลเล็กชั่นที่สมบูรณ์ซึ่งสามารถทำได้ Transcriptome เป็นรหัสที่กำหนดว่าจะทำสูตรใดและเมื่อใด ตำราอาหารยังคงอยู่ตลอดชีวิตในขณะที่การเปลี่ยนแปลง transcriptome ในการตอบสนองต่อปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม

ส่วนที่สำคัญอย่างหนึ่งของ transcriptome คือโมเลกุล mRNA Messenger RNA เป็น RNA ที่สื่อสารกับไรโบโซมในเซลล์เพื่อควบคุมเซลล์เพื่อสร้างโปรตีนต่างๆ โปรตีนเหล่านี้ใช้สำหรับฟังก์ชั่นที่หลากหลาย ส่วนอื่น ๆ อาจไม่ได้รหัสโดยตรงสำหรับการผลิตโปรตีน แต่ทำสิ่งต่าง ๆ เช่นการกำหนดโครงสร้างของเซลล์และควบคุมการแสดงออกของยีน ส่วนประกอบต่างๆของ transcriptome ทำให้สิ่งมีชีวิตทำงานได้และตรวจสอบการแสดงออกของยีนภายในสิ่งมีชีวิตนั้น

ภายในเซลล์ต่าง ๆ ในร่างกาย transcriptome สามารถแตกต่างกันมาก ตัวอย่างเช่นเซลล์ตับมีอาร์เอ็นเอซึ่งทำให้เซลล์ตับและตรวจสอบให้แน่ใจว่าเซลล์ทำหน้าที่ที่จำเป็น ในทางตรงกันข้ามเซลล์ผิวมี transcriptome ที่แตกต่างกันซึ่งป็นยีนที่จำเป็นในการทำให้เซลล์เป็นเซลล์ผิว ทั้งตับและเซลล์ผิวหนังมีสำเนาของจีโนมอย่างสมบูรณ์ แต่ transcriptomes จะตรวจสอบว่าส่วนใดของจีโนมถูกเปิดใช้งาน

เช่นเดียวกับ DNA มันเป็นไปได้ที่จะจัดลำดับ RNA การหาลำดับของยีนสามารถทำได้เพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับการกระทำของเซลล์และ DNA ของสิ่งมีชีวิตที่เป็นโฮสต์และเพื่อระบุสถานที่ที่การแสดงออกของข้อมูลพันธุกรรมผิดไป เมื่อเซลล์ตับกลายเป็นมะเร็งเช่นมันเป็นเพราะ transcriptome ไม่ทำงานตามที่ควรจะเป็นและยีนสำหรับมะเร็งได้เปิดใช้งานหรือเซลล์ขาดระเบียบในบางวิธีทำให้พวกเขาเติบโตจากการควบคุม การเรียงลำดับ RNA ในเซลล์มะเร็งสามารถช่วยให้นักวิจัยทราบว่ายีนใดที่ถูกกระตุ้นหรือไม่ทำงานเพื่อก่อให้เกิดมะเร็ง