นิ้วสังกะสีคืออะไร?

นิ้วสังกะสีเป็นโปรตีนรูปนิ้วที่เกิดจากกรดอะมิโนเฉพาะในโปรตีนที่จับกับไอออนสังกะสี โปรตีนเหล่านี้มักจะจับกับ DNA และ RNA เพราะรูปร่างของพวกมันช่วยให้เกิดการโต้ตอบอย่างใกล้ชิดของโดเมนกับนิวคลีโอไทด์ของ DNA และ RNA คุณสมบัติการจับนิวคลีโอไทด์ของพวกมันอนุญาตให้พวกเขาทำงานในการควบคุมการแสดงออกของยีนและในการประกอบไวรัส

มีโครงสร้างของซิงค์นิ้วหลายประเภท แต่รุ่นทั่วไปส่วนใหญ่ประกอบด้วย alpha helix และ beta sheet ซึ่งเป็นโครงสร้างรองที่พบมากที่สุดสองชนิดในโปรตีนที่ด้านใดด้านหนึ่งของไอออนสังกะสีอย่างน้อยหนึ่งอัน alpha helix และ beta sheet ถูกจัดขึ้นในตำแหน่งโดยซีสตีนและฮิสทิดีนตกค้างประสานงานกับไอออนสังกะสีผ่านอะตอมไนโตรเจนและกำมะถัน นิ้วซิงค์กับ DNA และผ่านการทำงานร่วมกันของกรดอะมิโนที่รอบนอกกับคู่ฐานที่ศูนย์กลางของเกลียวคู่ดีเอ็นเอ มันเป็นโดเมนโปรตีนที่มีขนาดกะทัดรัดและขนาดที่เล็กทำให้สามารถอยู่ใกล้กับฐานคู่ดีเอ็นเอ

โปรตีนเหล่านี้เป็นปัจจัยการถอดรหัสที่พบมากที่สุดในสิ่งมีชีวิต ปัจจัยการถอดรหัสคือโปรตีนที่จับกับ DNA และควบคุมการถ่ายโอนข้อมูลทางพันธุกรรมไปยัง RNA ความจริงที่ว่าโปรตีนเหล่านี้ไปสู่ ​​DNA เป้าหมายทำให้พวกเขามีคุณสมบัติในการปรับโครงสร้างทางวิศวกรรมเพื่อที่จะกำหนดเป้าหมายลำดับดีเอ็นเอที่น่าสนใจ

ตัวอย่างเช่น Zinc Finger Nuclease (ZFN) เป็นโปรตีนสังเคราะห์ที่มีโดเมนซิงค์นิ้วที่ได้รับการออกแบบทางวิศวกรรมที่หลอมรวมเข้ากับ endonuclease ที่ จำกัด หรือเอนไซม์ที่แยก DNA ZFN สามารถใช้ในการตัด DNA ในสถานที่เฉพาะและเป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการส่งเสริมการรวมตัวกันของ DNA เฉพาะไซต์ นิ้วมือที่ได้รับการออกแบบทางวิศวกรรมนั้นสามารถใช้เป็นปัจจัยในการถอดรหัสได้

Zinc finger domain พบได้ในโปรตีนไวรัสบางชนิดรวมถึงโปรตีน neocapsid (NC) ของ Human Immunodeficiency-1 (HIV-1) ไวรัส NC เป็นเป้าหมายของไวรัสที่น่าดึงดูดเนื่องจากเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการประกอบไวรัสและได้รับการอนุรักษ์อย่างสูง สารยับยั้งที่กำหนดเป้าหมายโดยเฉพาะนิ้วมือสังกะสีของโปรตีนไวรัสและไวรัส retroviral สามารถนำมาใช้เพื่อป้องกันการจำลองแบบของไวรัส การได้รับสารต้านไวรัสในลักษณะนี้เป็นพื้นที่ของการวิจัยทางชีวการแพทย์

โปรตีนเหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการเผาผลาญปกติของเซลล์ เพื่อให้มีประสิทธิภาพสารประกอบต่อต้านไวรัสต้องมีเป้าหมายเป็นโปรตีน retroviral Zinc finger โดยเฉพาะ โปรตีน retroviral เหล่านี้มีลำดับกรดอะมิโนที่แตกต่างกันและความแตกต่างของโครงสร้างจากโปรตีนนิ้วมือสังกะสีดังนั้นการได้รับสารยับยั้งการคัดเลือกจึงเป็นเป้าหมายที่ทำได้