ระบบบำบัดน้ำเสียที่ใช้ในการบำบัดน้ำเสียในครัวเรือนและน้ำเสียอื่น ๆ มักใช้ประโยชน์จากแบคทีเรียเพื่อช่วยในการกำจัดของเสียให้เป็นผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย ระบบไร้อากาศเกี่ยวข้องกับแบคทีเรียที่ไม่ต้องใช้ออกซิเจนในการประมวลผลของเสีย อย่างไรก็ตามออกซิเจนจำเป็นต้องมีในระบบแอโรบิก โดยทั่วไปจะต้องถูกปั๊มเข้าสู่ระบบเพื่อให้แน่ใจว่าแบคทีเรียสามารถประมวลผลของเสีย ระบบแอโรบิกมีข้อเสียบางอย่างเมื่อเทียบกับระบบแอนแอโรบิก แต่มีความเหมาะสมมากขึ้นสำหรับการใช้งานในบางสถานการณ์
ในระบบแอโรบิกแบคทีเรียจะใช้ในการบำบัดน้ำเสียล่วงหน้าเพื่อการกำจัดอย่างปลอดภัย แบคทีเรียดังกล่าวใช้ประโยชน์จากออกซิเจนและของเสียที่ถูกอัดเข้าไปในถังพักเพื่อเป็นแหล่งพลังงานเพื่อความอยู่รอดและการเติบโต ส่งผลให้เกิดการย่อยสลายของเสียและลดความเข้มข้นของจุลินทรีย์ที่เป็นอันตรายในผลิตภัณฑ์ของเสียขั้นสุดท้าย ระบบบำบัดแบบแอโรบิคมีสามประเภทพื้นฐาน (ATS): ระบบการเจริญเติบโตแบบแขวนลอย, เครื่องปฏิกรณ์แบบเรียงลำดับแบบลำดับและเครื่องปฏิกรณ์แบบฟิล์มคงที่
แบคทีเรียลอยไปทั่วทั้งถังหลักในระบบแขวนลอย อากาศจะถูกสูบฉีดไปทั่วของเสียที่เป็นของเหลว ขยะที่ผ่านการบำบัดจะตกตะกอนในถังที่สองและแบคทีเรียจะถูกหมุนเวียนกลับไปที่ถังหลัก ขยะเหลวที่ผ่านการบำบัดจะถูกส่งออกจาก ATS การรักษาสมดุลของเสียน้ำเสียและแบคทีเรียที่เหมาะสมเป็นสิ่งสำคัญเพื่อป้องกันการอุดตันของระบบการเจริญเติบโตที่ถูกระงับ
เครื่องปฏิกรณ์แบบต่อเนื่องแบบลำดับนั้นคล้ายกับระบบการเจริญเติบโตแบบแขวนลอยในแบคทีเรียนั้นลอยอย่างอิสระทั่วทั้งถัง อย่างไรก็ตามการสลายตัวและการทรุดตัวเกิดขึ้นในรถถังเดียว อากาศจะถูกส่งไปยังถังเดี่ยวนี้เฉพาะในช่วงการสลายตัว มันถูกปิดในระหว่างขั้นตอนการตกตะกอนเพื่อให้ของแข็งสามารถปรับตัวที่ด้านล่างของถัง จากนั้นน้ำทิ้งจะถูกสูบออกจากถังเพื่อให้ครบรอบ
ในขณะที่แบคทีเรียลอยอย่างอิสระในระบบทั้งสองประเภทนี้แบคทีเรียในเครื่องปฏิกรณ์แบบแผ่นฟิล์มยึดติดกับพื้นผิวโดยเฉพาะ การสลายตัวเกิดขึ้นในหนึ่งถังและการทรุดตัวจะเกิดขึ้นในถังที่สอง อากาศจะถูกส่งไปยังพื้นที่ของถังสลายตัวที่มีพื้นผิวที่ติดเชื้อแบคทีเรียเท่านั้น การหมุนเวียนของแบคทีเรียกลับไปที่ถังสลายไม่จำเป็นเพราะแบคทีเรียจะยังคงติดอยู่กับพื้นผิวที่พวกมันเติบโต
ระบบแอโรบิกในประเภทเหล่านี้มักจะมีราคาแพงกว่าระบบแอนแอโรบิกแบบดั้งเดิมทั้งในแง่ของต้นทุนเริ่มต้นและการบำรุงรักษา ระบบดังกล่าวมักจะมีการออกแบบที่ซับซ้อนและเกี่ยวข้องกับชิ้นส่วนที่เคลื่อนไหวได้มากกว่าระบบแบบดั้งเดิม พวกเขาต้องการกระแสไฟฟ้าสำหรับระบบการไหลเวียนของอากาศในช่วงระยะการย่อยสลายดังนั้นจึงมีค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานอย่างต่อเนื่องเช่นกัน
แม้จะมีค่าใช้จ่ายสูงกว่าที่เกี่ยวข้องกับระบบดังกล่าว แต่ระบบแอโรบิกอาจจะเหมาะสมที่สุดหรืออาจเป็นทางเลือกเดียวภายใต้สถานการณ์บางอย่าง การผลิตน้ำทิ้งที่มีคุณภาพสูงทำให้ระบบดังกล่าวเหมาะสมกับพื้นที่ที่มีความอ่อนไหว ข้อ จำกัด ด้านพื้นที่อาจทำให้ระบบแอโรบิกไม่สามารถระบายน้ำทิ้งได้
สถานที่บางแห่งไม่อนุญาตให้ใช้ระบบแอโรบิกเนื่องจากรหัสและข้อบังคับของรัฐบาล คนอื่นอนุญาตให้ใช้ระบบแอโรบิก แต่ต้องการให้เจ้าของมีสัญญากับมืออาชีพเพื่อให้แน่ใจว่าการบำรุงรักษาระบบที่เหมาะสม อาจจำเป็นต้องใช้สัญญาณเตือนในบางพื้นที่เพื่อแจ้งเตือนเจ้าของในกรณีที่ระบบทำงานผิดปกติ รหัสและข้อบังคับสำหรับการติดตั้งและบำรุงรักษาระบบแอโรบิกมักจะบริหารงานโดยหน่วยงานของรัฐหรือท้องถิ่นเช่นกรมอนามัย
