ห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยาเป็นสถานที่ที่ผู้คนศึกษานิเวศวิทยา ห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยาอาจแตกต่างจากสถานที่ปฏิบัติงานนอกชายฝั่งซึ่งทำการศึกษาระยะยาวไปยังสถานที่ซ่อมที่สร้างขึ้นเต็มไปด้วยเครื่องมือทางวิทยาศาสตร์ ห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยามักติดอยู่กับโปรแกรมนิเวศวิทยาของมหาวิทยาลัยและวิทยาลัยและยังสามารถเชื่อมโยงกับหน่วยงานราชการ บริษัท เอกชนและองค์กรอนุรักษ์สิ่งแวดล้อม
นิเวศวิทยาการศึกษาวิธีการที่สิ่งมีชีวิตมีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกันและสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติรวมถึงฟิลด์ย่อยจำนวนหนึ่ง เช่นเดียวกับวิทยาศาสตร์ธรรมชาติอื่น ๆ นิเวศวิทยาผสมผสานการทำงานในทุ่งนาซึ่งทำให้ผู้คนสามารถสังเกตและรวบรวมตัวอย่างงานในห้องปฏิบัติการซึ่งให้โอกาสในการศึกษาทดลองและวิเคราะห์เพื่อสำรวจและยืนยันสิ่งที่ค้นพบและทฤษฎีที่พัฒนาโดยนักนิเวศวิทยา ความสามารถในการทำงานในห้องปฏิบัติการมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อนักนิเวศวิทยาหลายคนเช่นเดียวกับทรัพยากรที่อาจมีให้ในห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยาตั้งแต่อุปกรณ์สำหรับภาคสนามไปจนถึงอุปกรณ์ทดสอบดีเอ็นเอ
ห้องปฏิบัติการคงที่มักจะมีอุปกรณ์วิทยาศาสตร์ที่ใช้ในการศึกษาด้านนิเวศวิทยารวมถึงเครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์ทางชีวเคมี, กล้องจุลทรรศน์, อุปกรณ์รังสีและสถานที่เก็บตัวอย่าง ในห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยานักนิเวศวิทยาสามารถทำทุกอย่างตั้งแต่การผ่าต้นไม้ที่พบในสนามจนถึงการทดสอบดินที่สงสัยว่ามีการปนเปื้อนของรังสี ความสามารถในการทำการวิเคราะห์ทางเคมีที่ซับซ้อนยังมีประโยชน์สำหรับนักนิเวศวิทยาที่ทำงานในสาขาต่าง ๆ เช่นนักนิเวศวิทยาทางน้ำที่ต้องการเรียนรู้เกี่ยวกับเนื้อหาของตัวอย่างน้ำ
ห้องปฏิบัติการคงที่หลายแห่งมีพื้นที่สำหรับทดลอง ในห้องปฏิบัติการนักนิเวศวิทยาสามารถสร้างสภาพแวดล้อมที่ควบคุมอย่างสมบูรณ์เพื่อการทดลอง นักนิเวศวิทยายังสามารถใช้และจัดการสิ่งที่อาจเป็นอันตรายในความปลอดภัยของห้องปฏิบัติการสำรวจหัวข้อต่าง ๆ เช่นผลกระทบของการระเบิดของนิวเคลียร์ต่อการเกษตรพืชดัดแปลงพันธุกรรมหรือผลของการปล่อยพันธุ์ที่ไม่ใช่เจ้าของภาษาในสภาพแวดล้อมที่มีความเสี่ยง ความสามารถในการทดสอบและทดสอบเป็นสิ่งสำคัญสำหรับนักวิจัยที่ต้องการแสดงให้เห็นว่าพวกเขาได้ทำการสำรวจปัญหาอย่างเต็มรูปแบบในห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยา
ห้องปฏิบัติการภาคสนามนิเวศวิทยาอาจรวมถึงสิ่งใดก็ได้ตั้งแต่สิ่งอำนวยความสะดวกชั่วคราวที่นักนิเวศวิทยาใช้เพื่อเก็บและจัดการตัวอย่างใกล้สถานที่วิจัยไปยังพื้นที่ในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติซึ่งได้รับการอุทิศให้ใช้เป็นห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยาโดยนักวิจัย การทำงานในพื้นที่เฉพาะซึ่งถูกกำหนดไว้เป็นห้องปฏิบัติการนิเวศวิทยาเพื่อการศึกษานักนิเวศวิทยาสามารถสำรวจภูมิทัศน์ธรรมชาติและการควบคุมอิทธิพลต่าง ๆ เช่นผลกระทบของมนุษย์คนอื่น ๆ ต่อสิ่งแวดล้อม


