การจับแอนติบอดีเกิดขึ้นระหว่างการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันระหว่างแอนติบอดีและแอนติเจนที่จำเพาะ แอนติเจนคือเซลล์หรือโมเลกุลใด ๆ ที่ร่างกายจำได้ว่าเป็นสิ่งแปลกปลอมหรือไม่ได้เป็นของตัวเอง แอนติเจนสามารถมีหลายรูปแบบตั้งแต่สิ่งมีชีวิตที่ทำให้เกิดโรคเช่นแบคทีเรียและไวรัสไปจนถึงโมเลกุลที่เป็นพิษหรือภูมิแพ้ที่สร้างโมเลกุลสารก่อภูมิแพ้ การปรากฏตัวของแอนติเจนในร่างกายกระตุ้นเซลล์ของระบบภูมิคุ้มกันรวมถึงเซลล์ที่สร้างและหลั่งแอนติบอดี
แอนติบอดีเป็นโปรตีนที่มีโครงสร้างพื้นฐานที่โดดเด่น พวกมันประกอบไปด้วยโซ่พอลิเปปไทด์สี่ชนิดที่ยึดติดกันด้วยสะพานไดซัลไฟด์ซึ่งเป็นพันธะระหว่างอะตอมกำมะถัน แอนติบอดีแต่ละตัวมีโซ่ยาวหรือหนักสองอันและโซ่สั้นและเบาสองอัน แต่ละโซ่แสงพบที่ส่วนท้ายของหนึ่งในโซ่หนัก โซ่ทั้งสี่ถูกจัดขึ้นด้วยกันในรูปตัว Y ซึ่งช่วยให้เกิดความยืดหยุ่นจึงสามารถจับแอนติบอดีได้
แอนติบอดีแต่ละตัวมีความจำเพาะต่อแอนติเจนที่เฉพาะเจาะจง ความจำเพาะของแอนติบอดีจะถูกกำหนดโดยเว็บไซต์จับแอนติเจนที่พบในตอนท้ายของแต่ละห่วงโซ่แสง ลำดับของกรดอะมิโนที่พบในตอนท้ายของแต่ละห่วงโซ่แสงเป็นรูปร่างสามมิติที่เสริมเข้ากับรูปร่างของแอนติเจน เนื่องจากมีโซ่แสงสองอันสำหรับแอนติบอดีแต่ละตัวจึงมีแหล่งจับแอนติเจนสองแห่งดังนั้นแอนติบอดีแต่ละตัวสามารถจับแอนติเจนสองตัวได้
แอนติบอดีมีห้าระดับที่แตกต่างกัน เนื่องจากพวกมันเป็นโปรตีนทรงกลมทั้งหมดที่ผลิตขึ้นเป็นส่วนหนึ่งของการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันพวกมันถูกเรียกว่าอิมมูโนโกลบูลินโดยแต่ละชั้นจะมีตัวอักษร G, M, A, D และ E ในขณะที่อิมมูโนโกลบูลินทั้งหมดใช้โครงสร้างพื้นฐานเดียวกัน ขึ้นอยู่กับความแตกต่างในโซ่หนัก อาจมีแอนติบอดี้ที่แตกต่างกันจำนวนมากในแต่ละชั้นที่มีการจับแอนติบอดีจำเพาะที่เกิดขึ้นระหว่างโมเลกุลที่เฉพาะเจาะจงและแอนติเจนที่สมบูรณ์
แอนติบอดี้ที่แตกต่างกันแต่ละชนิดจะจับกับแอนติเจนชนิดต่าง ๆ และมีบทบาทที่แตกต่างกันในระบบภูมิคุ้มกัน ยกตัวอย่างเช่นอิมมูโนโกลบูลินจี IgG สามารถจับแอนติเจนสองตัวกระตุ้นเซลล์อื่น ๆ ในระบบภูมิคุ้มกันและอาจทำให้เกิดการเกาะติดกัน การเกาะติดกันเกิดขึ้นเมื่อมีการจับแอนติบอดีระหว่างแอนติบอดีและแอนติเจนหลายตัว สิ่งนี้สามารถเกิดขึ้นได้เมื่อแอนติเจนมีมากกว่าหนึ่งเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันมากกว่าหนึ่งซึ่งช่วยให้มันผูกกับแอนติบอดีมากกว่าหนึ่ง เมื่อแอนติเจนและแอนติเจนจับตัวกันมากขึ้นก็จะเกิดเป็นกอหรือเกาะติดกันซึ่งช่วยในการทำลายเซลล์ด้วยแอนติเจน
