ต่างจากเซลล์ยูคาริโอตเซลล์โปรคาริโอตเช่นแบคทีเรียทั่วไปไม่มีโครงสร้างส่วนบุคคลที่เรียกว่าออร์แกเนลล์ภายใน โดยทั่วไปจะไม่มีนิวเคลียสไมโตคอนเดรียหรือบริเวณอื่น ๆ ที่เกิดกระบวนการเมตาบอลิซึมแยกกัน ทุกอย่างส่วนใหญ่เป็นอิสระลอยภายในผนังเซลล์และเมมเบรนพลาสม่า เช่นเซลล์ยูคาริโอตมักจะมีกรด deoxyribonucleic (DNA) เป็นเส้นเช่นเดียวกับกรด ribonucleic (RNA) ซึ่งสามารถคัดลอกผ่านการถอดรหัส การถอดรหัส Prokaryotic โดยทั่วไปจะถูกควบคุมโดยเอนไซม์ที่เรียกว่า prokaryotic RNA polymerase ซึ่งจะต้องเริ่มต้นการถอดรหัสของ DNA ในขณะที่การยุติกระบวนการมักจะเกิดขึ้นโดยลำดับของนิวคลีโอไทด์อื่น ๆ
เมื่อเอนไซม์ RNA polymerase เดินทางไปตามความยาวของเกลียวดีเอ็นเอมันจะทำการไขที่ไซต์การถอดความและผู้ส่งสารการถ่ายโอนและ ribosomal RNA สามารถทำได้ โดยทั่วไปจะมีเอ็นไซม์สองชนิดในการถอดรหัสโปรคาริโอต หนึ่งเป็นเอนไซม์หลักที่สามารถทำสำเนา แต่ไม่สามารถหาเว็บไซต์ที่เหมาะสมในยีน รูปแบบของโฮเลนไซม์ของโมเลกุลมักจะสามารถเริ่มต้นการถอดความในพื้นที่ที่เฉพาะเจาะจงและดังนั้นจึงถูกออกแบบมาเพื่อค้นหาลำดับโปรโมเตอร์ที่บอกโมเลกุลเมื่อเริ่มคัดลอกดีเอ็นเอ holoenzyme ดำเนินการฟังก์ชั่นนี้ผ่านส่วนประกอบที่เรียกว่าซิกมา
การถอดรหัส Prokaryotic เริ่มต้นเมื่อ RNA polymerase ยึดติดกับไซต์ DNA ก่อการ โมเลกุลและโครงสร้างสองเส้นที่เรียกว่าคอมเพล็กซ์ปิดนั้นสามารถโต้ตอบและ DNA จะถูกเปิดเป็นลำดับเดียวที่อยู่ใกล้กับจุดที่เริ่มการถอดรหัส สิ่งนี้เรียกว่า open complex โดยทั่วไปแล้วเอนไซม์จะเริ่มต้นกระบวนการถอดรหัสโดยการสร้าง Transcripts ที่ไม่สามารถใช้งานได้ประมาณ 10 ตัวซึ่งจะถูกบล็อกไม่ให้โปรตีนซับซ้อน
เมื่อโปรตีนนี้ถูกปลดปล่อยออกมาแล้วเอนไซม์ก็จะทำการถอดรหัสต่อไป บางครั้งมีความแตกต่างในวิธีที่ RNA polymerase และโปรตีนจับกับ DNA อย่างรุนแรง ความแข็งแรงของพันธะนี้สามารถสัมพันธ์กับความน่าจะเป็นทางสถิติที่ฐานหนึ่งจะอยู่ในตำแหน่งที่กำหนด ฐานที่ใกล้เคียงกับลำดับฉันทามตินี้มักจะกำหนดว่าพันธบัตรจะแข็งแกร่งแค่ไหน
การถอดรหัส Prokaryotic ของ RNA มักจะเกิดขึ้นประมาณ 40 นิวคลีโอไทด์ในแต่ละวินาที โปรตีนบางชนิดสามารถเปลี่ยนอัตราที่เกิดขึ้นและความเร็วในการคัดลอกลำดับบางอย่างอาจแตกต่างกัน ยีนควบคุมมักจะเปลี่ยนวิธีการแสดงลำดับขึ้นอยู่กับสิ่งที่เซลล์ต้องการ การถอดความ Prokaryotic สามารถยกเลิกได้เช่นกันเมื่อลำดับใน RNA ทำให้โมเลกุลซับซ้อนและ DNA แยกออกจากกันหรือเมื่อโปรตีนจำเพาะจับและเดินทางไปยังเอนไซม์ RNA polymerase
