ระบบสามโดเมนเป็นวิธีการจำแนกชีวิตของเซลลูลาร์ซึ่งถูกเสนอโดย Carl Woese ในปี 1990 ในขณะที่ระบบสามโดเมนพบกับการต่อต้านครั้งแรกมันได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางเนื่องจากการค้นพบทางวิทยาศาสตร์ที่สนับสนุนข้อเสนอของ Woese . ภายใต้ระบบสามโดเมนชีวิตของเซลล์ทั้งหมดสามารถแบ่งออกเป็นสามโดเมน ได้แก่ Archaea, Bacteria และ Eukaryota และแต่ละโดเมนสามารถแบ่งออกเป็นอาณาจักร phyla คลาสและอื่น ๆ
ระบบการจำแนกประเภทนี้จำแนกความแตกต่างระหว่างสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตสิ่งมีชีวิตที่มีเซลล์ซึ่งประกอบด้วยนิวเคลียสและสิ่งมีชีวิตชนิดโปรคาริโอตสองชนิดสิ่งมีชีวิตที่มีเซลล์ซึ่งขาดนิวเคลียส ในขั้นต้นอาร์เคียและแบคทีเรียต่างถูกรวมเข้าด้วยกันเป็นโปรคาริโอตแม้ว่าแต่ละกลุ่มจะมีอาณาจักรของตัวเอง Woese แย้งว่า Archaea และ Bacteria มีความแตกต่างอย่างชัดเจนว่าแท้จริงแล้วพวกเขาอยู่ในโดเมนแยกต่างหากไม่ใช่เพียงแค่อาณาจักรที่แยกจากกัน
ความแตกต่างระหว่าง Archaea และแบคทีเรียส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับพันธุศาสตร์ที่ซับซ้อน เมื่อ Woese ตีพิมพ์ข้อเสนอของเขาครั้งแรกการวิจัยทางพันธุกรรมดูเหมือนจะแนะนำว่าทั้งสองอาณาจักรนั้นสืบเชื้อสายมาจากบรรพบุรุษร่วมกันและพวกเขาก็คล้ายคลึงกันมากพอที่พวกเขาจะไม่ต้องการโดเมนแยกกัน เป็นผลให้ระบบสามโดเมนถูกมองในขั้นต้นด้วยความสงสัย
อย่างไรก็ตามการวิจัยเพิ่มเติมชี้ให้เห็นว่า Woese นั้นถูกต้องจริงและสิ่งมีชีวิตเหล่านี้มีความแตกต่างทางพันธุกรรมดังนั้นพวกเขาจึงต้องการอาณาเขตของตนเอง Archaea และ Bacteria นั้นเป็นทั้ง prokaryotic แต่โครงสร้างของเซลล์นั้นแตกต่างกันอย่างเห็นได้ชัดและมี ribosomal RNA ที่แตกต่างกันอย่างมากซึ่งบ่งชี้ว่าโดเมนเหล่านี้ได้แยกจากกันเป็นเวลานานแล้วและส่วนใหญ่ไม่เกี่ยวข้องกัน ระบบสามโดเมนสำหรับการจำแนกสิ่งมีชีวิตดูเหมือนว่าจะมีความแม่นยำมากกว่าระบบก่อนหน้านี้ในขณะนี้ว่ามีการค้นพบหลักฐานที่สนับสนุนมัน
ภายใน Archaea มีเพียงอาณาจักรเดียวเท่านั้นที่เรียกว่า Archaea โดเมนแบคทีเรียยังมีเพียงอาณาจักรเดียวเท่านั้นที่รู้จักกันในชื่อ Bacteria ยูคาริโอต้าสามารถแบ่งออกเป็นสี่ก๊ก: สัตว์พืชเชื้อราและผู้ประท้วง ภายในแต่ละโดเมนจะมีความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตมากมายตั้งแต่เทพอาร์ทีอาร์ซึ่งสามารถเจริญเติบโตในสภาพแวดล้อมที่จะฆ่าสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ บนโลกไปจนถึงกล้วยไม้เขตร้อนที่เปราะบางในอาณาจักรพืช
ระบบนี้มีความสำคัญอย่างยิ่งสำหรับผู้ที่ศึกษาสิ่งมีชีวิตที่เป็นโปรคาริโอตเนื่องจากระบบสามโดเมนแสดงถึงความแตกต่างระหว่างแบคทีเรียและอาร์เคีย โดยทั่วไปแล้วนักวิจัยมีความเชี่ยวชาญในด้านใดด้านหนึ่งโดยใช้การวิจัยทางพันธุกรรมเพื่อเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับสิ่งมีชีวิตที่พวกเขาศึกษา บางคนยังคงใช้ระบบสองอาณาจักรซึ่งแบ่งชีวิตของเซลล์ออกเป็น Prokaryota และ Eukaryota และจากนั้นก็เข้าสู่อาณาจักรที่เกี่ยวข้อง แต่สิ่งนี้กำลังกลายเป็นสิ่งที่หายากมากขึ้นเรื่อย ๆ
