การเขียนโปรแกรมXBee®ใช้ในการสร้างไมโครคอนโทรลเลอร์และหน่วยที่คล้ายกันและการทำตามคำแนะนำที่เป็นประโยชน์สามารถทำให้การเขียนโปรแกรมภาษานี้ง่ายขึ้น การใช้คำสั่งที่ส่งผ่านรหัสมาตรฐานอเมริกันสำหรับการแลกเปลี่ยนข้อมูล (ASCII) มักจะดีกว่าเนื่องจากข้อ จำกัด การเขียนโปรแกรมผิดพลาด เมื่อตั้งค่าการเขียนโปรแกรมXBee®หนึ่งสามารถเปลี่ยนรหัสความถี่และสิ่งนี้ควรใช้ โปรแกรมเมอร์สามารถเปลี่ยนระยะเวลาในการส่งแพ็กเก็ตและจำนวนนี้ควรปรับตามจำนวนข้อมูลที่ไมโครคอนโทรลเลอร์ส่ง หากมีการสร้างโมดูลด้วยฟังก์ชั่นโหมดสลีปผู้ใช้ควรแน่ใจว่าได้ทำฟังก์ชั่นปลุกด้วย
เมื่อมีคนใช้การเขียนโปรแกรมXBee®มีสองวิธีในการสร้างรหัสและคำสั่งคือ: ไบนารีและ ASCII บางครั้งไบนารีก็ง่ายกว่าและหลีกเลี่ยงไม่ได้ แต่ผู้ใช้ควรใช้ ASCII เมื่อเป็นไปได้ หากคำสั่งถูกส่งผ่านระบบเลขฐานสองตัวเลขอาจสัมพันธ์กับอักขระ ASCII ซึ่งอาจทำให้ผู้ใช้ป้อนคำสั่งโดยไม่ตั้งใจและไม่ต้องการใช้
ต้องใช้แชนเนลดิจิทัลเพื่อส่งข้อมูลจากคอนโทรลเลอร์ไปยังอุปกรณ์ที่ทำด้วยการเขียนโปรแกรมXBee® โดยปกติXBee®จะถูกตั้งค่าด้วยหมายเลขช่องเริ่มต้นและในขณะที่ไม่จำเป็นต้องเปลี่ยนการตั้งค่านี้อาจมีปัญหาที่ไม่สามารถคาดเดาได้หากอุปกรณ์นั้นถูกใช้กับอุปกรณ์XBee®อื่น ๆ หากทุกอุปกรณ์ใช้แชนเนลเริ่มต้นเดียวกันคอนโทรลเลอร์หนึ่งตัวจะทำให้อุปกรณ์อื่นทั้งหมดสอดคล้องกับคำสั่งของคอนโทรลเลอร์หนึ่งตัว ด้วยเหตุนี้การเปลี่ยน ID เริ่มต้นด้วยคำสั่ง ATID จึงเป็นความคิดที่ดี
โดยทั่วไปข้อมูลแพ็กเก็ตจะถูกส่งระหว่างคอนโทรลเลอร์XBee®และอุปกรณ์และมีวิธีการเพิ่มประสิทธิภาพการส่งแพ็กเก็ต ด้วยคำสั่ง ATRO ในการเขียนโปรแกรมXBee®ผู้ใช้สามารถปรับระยะเวลาในการส่งแพ็คเก็ต การตั้งค่านี้ด้วยความเร็วที่ช้าลงจะดีกว่าสำหรับแพ็คเก็ตขนาดใหญ่เพราะจะทำให้คอนโทรลเลอร์และอุปกรณ์ใช้เวลาในการรวบรวมข้อมูลมากขึ้น ความเร็วที่เร็วกว่าปกติจะดีกว่าสำหรับแพ็กเก็ตขนาดเล็กเนื่องจากไม่ควรใช้เวลานานในการประกอบแพ็กเก็ตขนาดเล็ก
หากโมดูลถูกสร้างด้วยการเขียนโปรแกรมXBee®จะเป็นเรื่องปกติที่ผู้ใช้จะเพิ่มคำสั่ง sleep ซึ่งทำให้โมดูลไม่สามารถใช้พลังงานได้เมื่อไม่ได้ใช้งานโมดูล ในเวลาเดียวกันผู้ใช้หลายคนลืมที่จะทำให้คำสั่งปลุกซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญ หากไม่มีฟังก์ชั่นปลุกอุปกรณ์อาจต้องรีเซ็ตเพื่อเปิดใช้งานโมดูลอีกครั้ง


