Çevrimiçi perakendeciler, yasal, finansal ve pratik engeller gibi çoğu işletme ile aynı konuların birçoğunu içeren bir dizi önemli sorunla karşı karşıyadır. Çevrimiçi perakendeciler için benzersiz olan bazı özel e-ticaret sorunları da vardır.
Güvenlik muhtemelen tüm e-ticaret konularında en önemlisidir. Çevrimiçi ödemeleri kabul eden web sitelerinin, müşterilerin kart detaylarının korunmasını sağlamak için mümkün olan her şeyi yapma konusunda ahlaki ve yasal bir sorumluluğu vardır. Küçük firmalar harici ödeme yönetimi sisteminin kullanımını daha kolay bulabilirler. Bu, “ödeme” ödeme aşamasında müşterinin kart detaylarını doğrulayan ve ödemeyi alan bağımsız bir firmaya yönlendirildiği anlamına gelir. Bu, perakendeciye genellikle satış fiyatına dayanan bir komisyon olan bir ücrete mal olur, ancak stres ve zahmetten tasarruf sağlar.
Benzer bir kayda göre, çevrimiçi perakendeciler, sitelerinin virüslere ve diğer zararlı yazılımlara bulaştırılmaması için özel dikkat göstermelidir. Her ne kadar perakendecinin hatası olmasa da, müşterilerin bilgisayarlarına zarar veren bir site müşteri ilişkileri için yıkıcı olabilir. Belirli bir risk alanı olan noktalardan biri, bir sitenin enfeksiyon taşıyabilecek harici reklamlar ve bağlı kuruluş bağlantıları taşımasıdır.
Teslimat başka önemli bir konudur. Çevrimiçi bir perakendeci güvenilir olmayan bir teslimat yöntemi seçerse, müşteri sorumludur, teslimat firması yerine onları sorumlu tutacaktır. Perakendeciler ayrıca ücretsiz teslimat teklif etmek, sabit bir ücret talep etmek, ağırlığa göre ücret almak veya müşteriye bir teslimat firmasına ödenen fiili ücreti talep etmek gibi bir teslimat ücret politikasına da karar vermelidir.
Daha az bilinen e-ticaret sorunlarından biri, engelli site ziyaretçilerinin sorunudur. Perakendecinin bulunduğu yere bağlı olarak, engelli ayrımcılığına ilişkin yasalara tabi olabilirler; Bu, yalnızca bilgi tabanlı bir siteden ziyade bir e-ticaret sitesinde olması muhtemeldir. Bir siteyi mümkün olduğu kadar erişilebilir hale getirmek hem nezaket hem de iyi iş anlayışı meselesidir. Bu, sitenin erişilebilirlik teknolojisi ile özelleştirilebilmesini sağlamayı da içerir. Ayrıca, fotoğraflara ve Flash animasyonları gibi grafiksel metinlere alternatif metin seçeneklerinin olması da önemlidir; böylece içerik, görme engelli kullanıcılar için ekran okuyucusu teknolojisi ile işlenebilir.
Pek çok e-ticaret sorunu, çevrimiçi perakendecilerin malları eyalet genelinde ve hatta uluslararası hatlarda satmasından kaynaklanmaktadır. Bu, hem perakendecinin hem de satıcının yetki alanındaki vergi ve harçların toplanması ve dağıtılmasıyla ilgili karmaşık durumlara yol açabilir. Çevrimiçi bir perakendecinin malları yurtdışındaki bir müşteriye göndermesini engelleyen veya sınırlayan ihracat kısıtlamaları olabilir. Bazı ürünler için, müşterilerin asgari yasal yaşı eyaletten eyalete ve ülkeden ülkeye değişebilir.
