Sarı humma enjeksiyonları diğer aşılara benzer yan etkilere sahiptir. Yan etkileri olan çoğu insan sadece hafif rahatsızlık hissedebilir: Atış yeri ağrılı, morarmış ve şişebilir; Ayrıca, ağrı ve titreme ile birlikte hafif bir ateş olabilir. Şiddetli semptomları olan az sayıda insan nefes almada zorluk, davranış değişiklikleri, nöbetler, yüksek ateş, düzensiz kalp atışı, kurdeşen ve acil tıbbi tedavi gerektiren diğer semptomlar yaşayabilir. Sarı humma enjeksiyonlarının yan etkileri, genellikle bir atış yapıldıktan sonraki ilk bir saat içinde ortaya çıkar, ancak enjeksiyondan sonraki 30 gün içinde de gelişebilirler.
Tıp pratisyenleri, hiç sarı humma enjeksiyonu geçirmemiş insanlarda yan etkileri daha dikkatli izler. Bir aşı öyküsü olmadan, bir kişinin nasıl tepki vereceğini bilmek imkansızdır. Enjeksiyonu olan ve herhangi bir yan etki yaşamamış olanların, tekrarlayan çekimlerde yan etkileri görmesi son derece muhtemel değildir.
Pek çok insan, yalnızca sarı bir ateş atışından sonra, enjeksiyon bölgesinde şiddet veya sertlik gibi hafif etkiler yaşar. Hafif derecede ağrılı bir kişi ayrıca enjeksiyon bölgesinde kızarıklık, morarma ve belki de şişlik hissedebilir. Hafif ve kısa süreli ateş de görülebilir. Bu semptomlar için tıbbi tedavi genellikle gerekli değildir; belirtiler zamanla düzeltilmelidir. İstenirse, ateşi ve kederi hafifletmek için reçetesiz satılan ilaçları alabilirler.
Şiddetli belirtiler yaşayanlar derhal tıbbi yardım almalı. Sarı humma enjeksiyonlarından kaynaklanan ciddi yan etkiler genellikle alerjik reaksiyonlardan kaynaklanır ve ölümcül olabilir. Tipik haliyle, bu tür reaksiyonlara maruz kalanlar, tavuklara, yumurtalara veya jelatine alerjisi olan aşılarda yaygın olarak kullanılan tüm maddelerdir.
Bu tür alerjileri olanlar, sarı humma virüsünün sık görüldüğü Afrika ve Güney Amerika bölgelerine seyahat etmekten kaçınmaya teşvik edilir. Yumurta veya tavuk alerjisi olan bir kişinin bu bölgelere seyahat etmesi gerekiyorsa, doktorun, virüsü yakalamanın atıştan alerjik bir reaksiyondan daha hayati tehlike taşıdığına inanılması durumunda sarı humma aşısı önerebilir. Doktorlar daha az alerjik reaksiyona neden olma umuduyla daha düşük dozlarda aşı sağlayabilirler.
Bazı demografik özelliklerin sarı humma enjeksiyonlarında diğerlerinden daha ciddi yan etkilere maruz kalma olasılığı daha yüksektir. Belirtildiği gibi, kanatlı hayvan alerjisi olanlar risk altındadır. Hamile kadınların doğmamış çocuklara zarar verebileceği için aşı yaptırmamaları da tavsiye edilir. Bağışıklık sistemi zayıf olan ve ciddi bir hastalık sonucu organ yetmezliği yaşayanlara da enjeksiyona karşı tavsiye edilebilir. Dokuz aylıktan küçük çocukların ve özellikle altı aydan küçük çocukların olumsuz yan etkilere karşı özellikle savunmasız oldukları kabul edilir.
