İşlemin invazivliği göz önüne alındığında, çoğu lomber ponksiyon komplikasyonu nadirdir. En sık görülen komplikasyon on lomber ponksiyon hastasının dördünde ortaya çıkan ve genellikle bir hafta içinde düzelen bir baş ağrısıdır. Diğer komplikasyonlar daha ciddidir ancak daha az sıklıkta görülür. Nadir görülen lomber ponksiyon komplikasyonları olmasına rağmen menenjit, sinir kökü yaralanması ve uzun süreli sırt ağrısı olasıdır.
Lomber ponksiyon sonrası oluşan baş ağrısına postdural ponksiyon baş ağrısı denir. Sebepleri bilinmemektedir. Kadınlarda erkeklerden daha sık, daha genç ve yaşlı hastalarda daha az görülür. Çeşitli çalışmalar, lomber ponksiyon için kullanılan iğne seçiminin, bu tip lomber ponksiyon komplikasyonlarının görülme sıklığını etkilediğini göstermektedir. Eğik uçlu iğnelerin aksine kurşunkalem iğnelerinin postdural delinme baş ağrısının oluşumunu önemli ölçüde azalttığı görülmektedir.
Çalışmalar, ne yatak istirahati ne de uzun süre yatkın kalmanın postdural ponksiyon baş ağrısını önlediğini göstermektedir. Oral kafein bazı geçici rahatlama sağlar, ancak kısa etkilidir ve baş ağrısı ortadan kaldırmaz. En etkili tedavi epidural kan yamasıdır. Yama, postpunktur uygulanır ve postdural ponksiyon baş ağrısı geçiren hastaların yüzde 98'ine rahatlama sağlar.
Ciddi lomber ponksiyon komplikasyonları tonsiller herniasyonu, intrakraniyal kanama ve enfeksiyonları içerir. Bu tip komplikasyonlar nadirdir. Bazı komplikasyonlar, sağlığı veya durumu tehlikeye atan hastalarda daha sık görülür. Mevcut ciddi tıbbi durumu olan hastalar, lomber ponksiyonlar sonucu tehlikeli komplikasyonlar geliştirmeye daha yatkındır.
Beyin omurilik sıvısı örnekleri lomber ponksiyondan elde edildi. Bu sıvı beyni ve omuriliği çevreler. Sıvının incelenmesi menenjit, multipl skleroz ve beyin kanaması gibi hastalıkların teşhisine yardımcı olabilir. Beyin omurilik basıncındaki değişiklikleri belirlemek için prosedür bazen önceden hazırlanmıştır. Sıvının uzaklaştırılmasından önce ve sıvının uzaklaştırılmasından sonra basınçtaki fark, bir beyin tümörünün veya enfeksiyonun teşhisine yardımcı olabilir.
Nörologlar veya diğer eğitimli sağlık personeli lomber ponksiyonlar yapar. İşlem genellikle alt sırtta gerçekleşir. Doktorlar önce delinme için seçilen alanın etrafındaki alanı temizler, sterilize eder ve bazen uyuştururlar. Omurların arasına bir iğne sokar ve beyin omurilik sıvısı ile dolu alana hareket eder. Sıvı çekildikten sonra doktorlar iğneyi çıkarır ve delinmeyi steril bir pansumanla kapatır.
