DNA mikroarray analizi, bir hücrede hangi genlerin belirli bir zamanda açıldığını belirlemek için moleküler biyoloji ve tanısal tıpta kullanılır. Bu teknik, multipleks test olarak bilinir, çünkü tek bir analizde binlerce numuneyi ölçebilir. DNA mikroanaliz teknikleri, deneyin özel gereksinimlerine bağlı olarak, RNA'nın yanı sıra DNA üzerinde yapılan deneylerden elde edilen verileri yorumlamak için kullanılır.
DNA mikroarray analizinin temeli, DNA moleküllerinin yüksek özgüllüğü ve belirli bir geni temsil etmek için eşsiz DNA dizileri seçme yeteneğidir. Üzerine kimyasal bir matris yerleştirilen bir cam veya silikon çipten yapılmış katı bir yüzey üzerinde bir mikro dizi analiz deneyi yapılır. Matris yüzeyinde DNA veya RNA probları sıralı sıralarla dizilir.
Çip gerekli problarla ayarlandıktan sonra, incelenen hücreler hazırlanır. Hücreleri hazırlamak için, içerdikleri nükleik asitlerin izole edilebileceği şekilde kırılmaları gerekir. Hücrelerde bulunan nükleik asitleri çıkarmak ve konsantre etmek için bir dizi reaktif eklenir. Daha sonra, nükleik asit ekstresi, çipe ilave edilir, daha sonra probların hücresel nükleik asitlere etkileşmesi ve bağlanması için zaman vermek üzere birkaç saat boyunca bırakılır. Son olarak, hücresel nükleik asitlerin problara bağlandığı konumları belirlemek için çipe bir başka reaktif serisi eklenir.
Mikroarray analizi daha sonra hangi probların hücresel nükleik asitleri tespit edebildiğini belirlemek için kullanılır. Tek bir çip onbinlerce benzersiz prob içerebileceğinden, bu genellikle karmaşık bir analizdir. Çip üzerindeki probların sırası, bir bilgisayar veritabanında saklanır, böylece sonuçlar kolayca elde edilebilir. Bir çip ve veri tabanını kullanarak, bir bilim adamı sondalara bağlanmış ve bu nedenle orijinal hücresel özütte mevcut olan genlerin bir listesini geliştirebilir.
Mikroarray analiz tekniği gen ekspresyon profilinde yaygın olarak kullanılır. Bu tür bir deneyde, mikro dizi, hücrelerde gen ekspresyonunun modellerini incelemek üzere ayarlanmıştır. İlgilenilen genler için problar mikroarray üzerinde bulunur ve deney tamamlandığında, mikroarray veri analizi, çalışılan genlerden hangisinin belirli bir zamanda açıldığını belirleyebilir.
Bu tekniğin diğer kullanımları, karşılaştırmalı genomik hibridizasyon ve SNP tespitini içerir. Karşılaştırmalı genomik hibridizasyon, ilgili organizmaların hücrelerinde genomik içeriği inceleyen bir testtir. Bu tür analiz, farklı türler arasındaki genetik ilişkiler hakkında bilgi sağlar.
SNP tespiti, adli analizde, genetik bağlantı analizinde ve genetik hastalık risklerinin değerlendirilmesinde kullanılabilecek bir tekniktir. SNP'ler tek nükleotid polimorfizmidir, genom üzerindeki iki olası baz çifti dizisinin olduğu yerlerdir. SNP'ler, farklı etnik ve coğrafi popülasyonlarda farklı SNP varyasyonlarının mevcut olması nedeniyle bir dizi faydalı genetik bilgi sağlayabilir.
