Gastrointestinal sistem, temel olarak gıdaların işlenmesinden, besin maddelerinin emiliminden ve vücut atığının ortadan kaldırılmasından sorumlu olan vücut sistemlerinden biridir. Ağızdan başlayıp özofagusa, mideye ve bağırsaklardan başlayıp anüsle biten uzun tüp benzeri içi boş organlardan oluşur. Bu sistem çoğunlukla sfinkter adı verilen halka benzeri kaslarla farklı bölümlere ayrılmıştır. Gastrointestinal sistemin diğer aksesuar organları, dişleri, dili, tükürük bezlerini, pankreas, safra kesesi ve karaciğeri içerir.
Yiyecekler ağzına girdiğinde, dişler yiyeceği daha küçük parçalara ayırır ve tükürük bezleri, yiyeceği nemlendirmeye ve karbonhidratların sindirimine başlamasına yardımcı olan enzimler içeren tükürük salgılamasını salgılar. Dil, yaklaşık 9.8 inç (yaklaşık 25 cm) uzunluğunda olan, yemek borusuna yutulmak üzere yiyeceği farinksin içine itmeye yardımcı olur. Yemek borusu dalgalarının peristalsis olarak da bilinen dalga hareketleriyle mideye itilir. Yemek borusu ve mide arasında, yiyeceğin mideye girmesine izin vermek için açılan ve daha sonra yiyeceğin tekrar geri dönmesini önlemek için kapanan alt özofagus sfinkteri (LES) bulunur.
Midedeki hareketler, yiyeceğin mide suları ve enzimlerle karışımını sağlar, daha küçük parçalara dönüştürür ve tutarlı bir şekilde yarı sıvı hale getirir. Midede genellikle 1500 ml (yaklaşık 50 ons) yiyecek bulunur, ancak bu miktarın yaklaşık iki katı tutabilir. Midenin diğer işlevleri arasında, yiyeceğin depolanması, bazı besin maddelerinin emilmesi ve mide asitlerinin hareketleriyle bakterilerin öldürülmesi sayılabilir. Midede yiyecekleri işledikten sonra, mideyle duodenum arasında bulunan pilor sfinkterinden geçer. Duodenum ince barsakların ilk kısmı olup, bunu jejunum ve ileum izlemektedir.
Toplam uzunluğu yaklaşık 19.6 fit uzunluğunda (yaklaşık 6 metre) olan ince bağırsaklarda, yiyecekler daha sonraki işlemler için pankreas, karaciğer ve safra kesesinden gelen maddelerle karıştırılır. Gastrointestinal sistemin ince bağırsağının ana işlevi, vitaminler, amino asitler ve glukoz gibi besin maddelerinin gıdalardan emilimidir. Bu besinler daha sonra düzgün çalışması için vücut tarafından kullanılacak olan kan akışına gider.
İleoçekal valf, ince bağırsaklardan gelen malzemenin kalın bağırsağa girmesine izin verir. Yaklaşık 5 metre uzunluğundaki (1,5 metre) kalın bağırsakta, suyun ve diğer maddelerin yeniden emilimi ve dışkı maddelerinin oluşumu gerçekleşir. Gastrointestinal sistemin kalın bağırsaklarındaki bakterilerin varlığı, vücut içindeki K ve B12 gibi bazı vitaminlerin işlenmesinde önemlidir. Dışkı malzemeleri daha sonra dışkılama işlemi yoluyla anüsün dışına atılacak olan kalın bağırsağın uzunluğu boyunca rektuma doğru itilir.
