Bilgisayar mühendisliği ve bilgisayar bilimi, birbiriyle örtüşen birçok özelliğe sahiptir, ancak temel fark, edinilen becerilerin kullanımında bulunur. Bilgisayar mühendisliği donanım ve elektronik üzerine daha fazla odaklanırken, bilgisayar bilimi bilgisayar programlama ve yazılım tasarımına odaklanmaktadır. Her iki alan da ileri matematik, fizik ve programlama çalışmasını içerir, ancak bilgisayar mühendislerinin donanım geliştirmek için bu becerileri kullanma becerilerini programlar yapmaktan daha fazla kullanmaları muhtemeldir. Bu nedenle bilgisayar bilimcileri, bilgilerini ve programların ve işletim sistemlerinin nasıl çalıştığını ve donanım için daha iyi yazılım çözümleri nasıl yaratacağını anlamak için bilgilerini kullanırlar.
Bilgisayar mühendisliği ve bilgisayar bilimleri lisans programlarındaki öğrenciler, programlar arasında örtüşen birkaç ders alırlar. Her iki program da genellikle çoklu hesap, doğrusal cebir, fizik, bilgisayar mimarisi, ağ ve programlama dersleri gerektirir. En büyük fark, bilgisayar bilimi öğrencilerinin bilgisayar mühendisliği öğrencilerinden çok, yazılım tasarımında, veri algoritmalarında ve işletim sistemlerinde daha fazla ders almalarıdır. Bilgisayar mühendisliği öğrencileri, elektronik, yapay zeka, dijital mantık devreleri ve dijital donanım alanlarında çeşitli dersler alırlar ve daha fazla fiziksel kavram üzerinde çalışma eğilimindedirler. Hem bilgisayar mühendisliği hem de bilgisayar bilimi öğrencileri, genellikle öğrendikleri becerileri gösteren büyük bir projeyi tamamlayarak çalışmalarına son verir.
Bilgisayar mühendisliği, bilgisayar bilimlerinden çok daha fazla fiziksel bir yaklaşım içermektedir. Bilgisayar mühendisleri bilgisayar ağları kurar, donanımı birleştirir ve bilgisayar sistemlerini birçok nesneye yerleştirir. Bilgisayarları daha verimli veya daha taşınabilir hale getirmenin bir yolunu bulmak için devre kartlarını monte edebilir veya laboratuarda çalışabilirler. Bilgisayar mühendisleri, bilim adamları bilgisayar mühendislerinin oluşturduğu sistemler ile kullanılacak programları oluştururken bilgisayar bilimcileri ile de çalışabilirler. Bilgisayar mühendisliği ve bilgisayar bilimlerinde kullanılan programlama arasındaki küçük bir fark, mühendislerin sistemin düzgün çalışmasını sağlayan programı oluşturabilmesi ve bilgisayar bilim adamlarının ana işletim sistemi için çeşitli programlar oluşturmasına izin verebilmesidir.
Bir bilgisayar bilimcisi, yazılım mühendisliğinin soyut ayrıntılarına daha çok odaklanır, ancak aynı zamanda bilgisayar mühendislerinin sahip olduğu donanım bilgisinin de çoğunu içerir. Donanım ve yazılımın birlikte nasıl çalıştığını ve donanımın özelliklerinden yararlanan programların nasıl tasarlandığını bilirler. Bilgisayar bilimcileri, programlarını oluştururken, bir programın değerlerini doğru hesaplamasını sağlamak için sayısal analiz ve algoritma bilgilerini kullanırlar. Yazılım yamaları oluşturur, programları tamamlar ve hatta tüm işletim sistemlerini oluştururlar ve genellikle yazılım mühendisleri ve diğer bilgisayar bilimcilerini içeren bir şirkette çalışan bir ekipte çalışırlar.
