Klorheksidin yan etkileri çeşitlidir, çünkü bu antiseptik çeşitli preparatlarda kullanılır. Genellikle ağız sularında, sabunlarda veya cerrahi preparat sıvılarında ve kontakt lens solüsyonlarında bulunur. Bir kişi anafilaktik şok gibi maddeye sistemik reaksiyon göstermediği sürece, reaksiyonların çoğu, klorheksidinin vücutla temas ettiği yerel olarak meydana gelir. Olumsuz bir etki meydana gelirse, ağız durulamaları ağızda semptomlara neden olur, sabunlar cilt reaksiyonlarına neden olur ve kontakt lens veya göz cerrahi solüsyonlarının gözleri etkilemesi muhtemeldir.
Bu kimyasal maddeye alerjisi olan herhangi bir kişi, herhangi bir biçimde kullanımına sistemik bir tepki verebilir. Bu klorheksidin yan etkilerinin nadir belirtileri soluk almanın zorluğu ve kurdeşendir. Ağız, yüz ve dilde şişlik de sık görülür. Bu belirtiler acil tıbbi yardım gerektirir.
Diğer durumlarda, klorheksidin yan etkileri maruz kalmanın meydana geldiği alanda ortaya çıkma eğilimindedir. Örneğin, ağızda durulama, artan plak, dişlerin kahverengi veya siyah lekelenmesi ve ağızdaki yaralar gibi yan etkiler için kaydedilmiştir. Yiyecekler ve içecekler farklı tadabilir veya beyaz dil gibi yan etkiler veya kanama sakızları oluşabilir. Tavsiye edilmeyen ağız durulama yutulması gastrointestinal rahatsızlık ve ağrı gibi mide semptomlarına veya nadir durumlarda kolite neden olabilir.
Deri temasıyla ilişkili klorheksidin yan etkileri sıklıkla döküntü içerir. Bazı hastalar cildin yandığını veya soyulduğunu not eder. Alternatif olarak, tekrarlanan kullanım sürekli tahrişe veya kaşıntıya neden olabilir. Bazı insanlar düzenli kullanımda kontakt dermatit geliştirir ve bu içerikten yoksun bir sabuna geçmesi gerekir. Hayvanlar ayrıca veterinerlik uygulamalarında yaraları temizlemek için kimyasal olarak kullanılabileceğinden, klorheksidinden cilt tahrişine neden olabilir.
Birçok göz cerrahı, gözleri temizlemek ve ameliyat için hazırlamak için klorheksidinli preparatlar kullanır. Bunlar daha yüksek yan etki riski ile ilişkilendirilebilir, çünkü kimyasal daha büyük miktarlarda bulunur. Maruz kalmayla ilişkili bazı olumsuz reaksiyonlar arasında kornea ülseri, göz ağrısı veya tahriş ve konjonktiva şişmesi, gözlerin beyazını kaplayan mukoza bulunmaktadır. Nadir durumlarda, gözlere zarar gelmesi kornea onarımını gerektirebilir.
Kontakt lens çözeltilerinde kullanılan bu kimyasal miktarı düşüktür. Yine de, bazılarında göz ağrısı veya gözlerin tahrişi dahil klorheksidin yan etkileri görülür. Bu belirtiler devam ederse, insanlara doktorlarla konuşmaları veya en azından klorheksidin içermeyen bir kontakt lens çözeltisine geçmeleri önerilir.
