T hücreleri ve B hücreleri gibi bağışıklık sistemi hücreleri, yüzeylerinde yabancı istilacıları tanımalarını ve onlara saldırmalarını sağlayan proteinlere sahiptir. Bu proteinler üzerindeki alanlar hücreden hücreye değişebilir ve çeşitli tehditlere tepki göstermelerini sağlar. Nadiren, T hücreleri ve B hücreleri, vücudun kendi hücreleri tarafından eksprese edilen, otoantijen olarak adlandırılan proteinlere tepki veren üretilirler. Klonal silme, bu hücrelerin vücutta serbest bırakılmadan önce nötrleştirilmelerine izin veren ve sağlıklı dokuya saldırmaya başlayabilecekleri bir süreçtir.
T hücreleri kemik iliğinde üretilirler, ancak kalbe yakın bir bez olan timusta olgunlaşırlar ve kemik iliğinde B hücreleri üretilir. Farklı menşe yerlerine rağmen, bu hücre tiplerinin her ikisi de otoantijenlere tepki gösteren olgun immün hücrelerin kan akışına salınmamasını sağlamak için benzer bir klonal silme yöntemi kullanır. Olgunlaşma sürecinde, bu hücreler makrofajlar ve timik dendritik hücreler gibi sınırlı sayıda hücre ile temas eder. Bu hücreler, antijen adı verilen ve immün hücrelere sundukları çeşitli yüzey proteinlerine sahiptir, böylelikle reaksiyonu üreten hücrelerin yabani otları giderilebilir.
Timusu örnek olarak kullanmak için timik dendritik hücreler, T hücrelerinin yüzey proteinlerini bağlama girişiminde bulunmalarını, klonal silme için taramalarını sağlayan bir sunum işlemi kullanır. Bu otoantijenlere reaksiyon gösteren olgunlaşmamış T hücreleri, timik hücre ile bir protein kompleksi oluşturur. Bu protein kompleksinin oluşması durumunda, T hücresinde apoptoz denilen, kendi kendini imha eden bir diziyi tetikler, böylece olgunlaşmaz ve vücuda girer, böylece başka bir hücreyle karşılaşırsa zararlı bir tepki verebilir. bu protein.
Vücut, timusta ve kemik iliğinde görülenlerden başka birçok hücre tipi içerir, bu nedenle klonal silme, normalde bu dokularda bulunmayan otoantijenleri hesaba katmalıdır. Timüs bunu, pankreas dokusunda olduğu gibi genellikle başka yerlerde bulunan yüzey proteinlerini içeren timik dendritik hücrelere sahip olarak yapar. Klonal silme daha sonra normal olarak bu pankreas proteinlerine reaksiyona girecek olan bağışıklık hücrelerinde meydana gelebilir ve benzer bir işlem ilikteki olgunlaşan B hücrelerini düzenler. Diyabet gibi bazı hastalık durumları, kısmen, vücudun antijenlerinin bağışıklık hücrelerini olgunlaştırarak, bu hücrelerin olgunlaşmasına ve sağlıklı dokulara saldırmasına izin vermemesine rağmen, vücudun antijenlerinin tamamını gösterememesinden kaynaklanabilir.
