Hem loratadin hem de setirizin antihistaminik tipleri olsa da, her biri alerji semptomlarını farklı şekillerde tedavi eden farklı bir kimyasal bileşiktir. Bu ilaçların her ikisi de aynı alerji tipleri için verilir ve hapşırmaya, burun kaşıntılarına ve sulu gözlere karşı etkilidirler ve kovanlar ve sistemik alerjik reaksiyonlar gibi semptomlara karşı etkisizdirler. Bu ilaçların etkisindeki benzerliklere rağmen, kimyasal bileşimleri farklıdır ve sonuç olarak onları alan hastalar üzerinde farklı etkileri vardır.
Moleküler olarak, loratadin ve setirizin, farklı şekillerde yapılandırılmıştır. Loratadin, 22 karbon atomu, 23 hidrojen atomu, iki azot atomu, iki oksijen atomu ve bir klorin atomundan oluşur. Bu atomlar, birkaç farklı dalı olan bir moleküle düzenlenir. Setirizin, uzun bir zincire yerleştirilmiş ve iki hidroklorür molekülüne bağlı 21 karbon atomu, 25 hidrojen atomu, üç oksijen atomu, iki azot atomu ve bir klorin atomundan oluşur. Yapı taşları benzer olmasına rağmen, bu moleküllerin düzenlenmesi alerji semptomlarıyla farklı şekillerde mücadele etmelerini sağlar.
Loratadin ve setirizin arasındaki ana farklardan biri, hastaların bunları alırken yaşayabileceği yan etki tipleridir. Her iki ilacın kullanımında ağız kuruluğu ve mide-bağırsak rahatsızlığı görülürken, loratadin'in ayrıca baş ağrısı, ağız yaraları, sinirlilik ve huzursuzluğa neden olduğu bilinmektedir. Setirizin ise bazı hastalarda ciddi olabilecek uyuşukluğa neden olabilir. Setirizin kullanan hastaların nefes almada zorluk çekmesi de mümkündür; bu, hasta anafilaksiye girmediği sürece loratadin kullanan hastalarda genellikle görülmeyen bir yan etkidir.
Loratadin ve setirizin arasındaki diğer bir fark, her ilacın veriliş şeklidir. Yetişkinlere genellikle bu ilaçlardan herhangi birinin günde bir kez 10 miligram verilirken, iki yaşın üzerindeki çocuklara genellikle bu miktarın yarısı verilir. İki yaşından küçük çocuklar için belirlenmiş bir loratadin dozu yoktur, oysa altı ay ile iki yaş arasındaki çocuklar güvenli bir şekilde 2.5 miligram setirizin alabilir.
Yüksek dozlarda loratadin ve setirizinin uzun vadeli etkileri de farklıdır. Laboratuar testlerinde, setirizin, önerilen maksimum dozun çok üstünde bir dozda verildiğinde bile kanser riskini artırmadı veya doğurganlığı azaltmadı. Aşırı derecede yüksek loratadin dozları, erkek doğurganlığının azalmasının yanı sıra kanser riskinde artışa yol açmıştır.


