Peptid bağları, yalnızca protein molekülleri içinde bulunan bir tür kovalent bağdır. Bu bağlar daha sonra proteinler oluşturmak üzere bir araya getirilen peptid zincirleri oluşturmak için amino asitleri bir araya getirir. Kovalent bağlar, bir molekül içindeki bir atomun başka bir moleküldeki bir atomla bir, iki veya üç elektronu paylaştığı zaman oluşur. Bu tür bağlar güçlüdür ve kırılması zor olabilir.
Tüm proteinler çok özel bir şekilde birbirine bağlanan amino asit zincirlerinden yapılır. Çoğu amino asit, bir tarafta tek bir karboksil grubuna (-COOH) ve diğer tarafta bir amino grubuna (-NH2) sahiptir. Komşu amino asitler, bir asidin karboksil grubu diğerinin amino grubuyla birleştiğinde bir peptid bağı oluşturabilir.
Amino asitler arasında peptid bağları oluştuğunda, bir su molekülü kaybolur. Bu tip reaksiyona yoğunlaşma reaksiyonu denir. Su molekülü (H20) karboksil grubundan bir hidroksil (-OH) ve amino grubundan bir hidrojen atomu (H) kaybıyla yaratılır. Tüm amino asitlerin bu şekilde birbirine bağlanması, yapılan proteinin şeklini belirleyen faktörlerden biridir.
Her bir amino asit eşleşmesi arasında tek peptid bağları meydana gelir. Proteinlere polipeptitler de denir, çünkü bunlar genellikle onlarca ve hatta yüzlerce amino asitten peptid zincirlerine birleştirilir. Bu, proteinlerin birçok peptid bağı içerdiği anlamına gelir.
Bir peptid bağını kırmak için, bir hidroliz reaksiyonu - bir yoğuşma reaksiyonunun tam tersi - gerçekleşmelidir. Hidroliz reaksiyonları, proteinleri peptid zincirlerine veya peptitleri tekli amino asitlere bölerken meydana gelir. Hidrolizde, peptit bağına bir su molekülü eklenerek suyun ayrılmasına neden olur. Hidroksil grubu (-OH), bir amino asidin karboksil grubuna, hidrojen atomu (H) diğerinin amino grubuna bağlanır.
Peptid bağları son derece kararlıdır, bu da kırılmalarının zor olduğu anlamına gelir. Bu, çoğu yaşam formunda yaşamsal rol oynadıkları için proteinler için özel bir öneme sahiptir. Örneğin, enzim adı verilen proteinler canlılar içindeki hemen hemen tüm kimyasal reaksiyonları kontrol eder. Ayrıca, bir proteinin şekli, bu proteinin ne kadar iyi çalışması için hayati öneme sahiptir. Peptit bağlarının gücünün yanı sıra proteini oluşturan amino asitlerin sırası, her bir özel protein tipinin şeklini belirleyen ve muhafaza eden faktörlerdir.
