Sadelik uğruna, erkek üreme sistemi, iç ve dış bölümlere ayrılabilir. Dışarıdan, sistem penis ve skrotumdan oluşur. Skrotumun içinde testisler, epididim ve minibüsler ertelenir. Erkek üreme sisteminin diğer iç kısımları arasında prostat bezi, burbourethral bezleri ve üretra bulunur.
Penis, erkek üreme sisteminin en tanınmış bölümlerinden biridir ve iki ana bölümden oluşur. Glans veya penisin başı, cinsel deneyimin zevkine önemli ölçüde katkıda bulunduğuna inanılan bir bölümdür ve idrarın ve spermin vücuttan kaçmasına izin veren bir açıklık olan idrar eti içerir. Penisin ikinci kısmı, cinsel uyarılma sırasında sertleşen ve uzayan penisin silindirik kısmı olan şaftdır.
Penisin altında, skrotum olarak adlandırılan kese benzeri bir yapı vardır. Spermlerin üretilmesinden, depolanmasından ve testosteron üretiminden sorumlu olan testisler olarak bilinen iki oval şekilli parça içerir. Skrotum ayrıca, erkek üreme sistemi için bir boru ağı görevi gören epididimileri ve minibüsleri deferens'te barındırır. Skrotumun bir başka önemli işlevi, genleşme ve büzülme yoluyla, testislerin sıcaklığının, daha fazla veya daha az vücut ısısına maruz bırakılarak düzenlenmesine yardımcı olmasıdır.
Seminal veziküller mesanenin tabanının yakınında bulunur. Bu küçük kese benzeri yapılar, minibüslere deferens'i bağlar. Seminal sıvının çoğunluğu bu yapılar tarafından üretilir. Katkısı fruktoz bakımından zengindir ve bu nedenle spermlere mobil olması gereken yakıtı sağlar.
Prostat bezi, erkek üreme sisteminin iç kısmıdır. Mesanenin altında bulunur ve spermi besleyen sıvılara katkıda bulunarak semen üretiminde rol oynar. Üretra, idrarı mesaneden idrar eti yerine taşıyan bir geçittir. Prostat bezinin içinden geçen bu geçit ayrıca semen taşıyor. Üretra, semen ve idrarın karışmasına veya eşzamanlı taşınmasına izin vermeyecek şekilde yapılandırılmıştır.
Üretranın yanlarında, bazen Cowper'ın bezleri olarak adlandırılan, burbourethral bezleri bulunur. Bu yapılar, bir erkeğin cinsel olarak uyarıldığı ancak herhangi bir boşalmadan önceki dönemlerde sıklıkla penisten salgılanan berrak bir sıvı üretir. Sıvının boşalmadan önce üretilmesi gerçeği önemlidir, çünkü amaçlarından birinin yağlayıcı olarak görev yapmak olduğuna inanılmaktadır. Üretranın içine boşaldığı için, idrardan kaynaklanabilecek asiditeyi nötralize ettiğine de inanılmaktadır.
