Sindirim sistemindeki bakteriler trilyonlar arasındadır ve bu bakterilerin çoğu dost olarak adlandırılır. Bazı uzmanlar, dost bakterilerin insan konakçıları ile simbiyotik bir ilişkiye sahip olduğunu, çünkü insan vücuduna çeşitli faydalı şekillerde yardımcı olduklarını söylüyor. Sindirim sistemindeki diğer bakteri türleri, kolera, botulizm ve salmonelloz üretenler de dahil olmak üzere çok kolay değildir.
Değişken tahminler, sindirim sisteminde 300 ila 1000 bakteri türü olduğunu göstermektedir. Genel olarak, bağırsak florası olarak da bilinen bu bakteriler vücuda sindirime yardımcı olmak, bağışıklık sistemini güçlendirmek ve düşmanca olmayan organizmaların büyümesini engellemek gibi çeşitli şekillerde yardımcı olur. Dost bakteriler çoğunlukla kalın bağırsakta ve ince bağırsağın bir kısmında yaşar. Midenin asidik ortamı bakteri üremesine elverişli değildir.
Bakteriler doğumdan hemen sonra insan sindirim sistemini doldurmaya başlar. Uzmanlara göre en yaygın bakterilerden biri Bacteroides . Bu bakteriler ıspanak gibi bitki besinlerinin sindirimine yardımcı olur. Bakteroidler , insan vücudunun sahip olmadığı enzimleri salıverir ve böylelikle bitki besinlerinden elde edilen besinler emilebilir. İnsan vücudu Bacteroides çalışmaları nedeniyle K vitamini ve bazı B vitaminleri alır.
Lactobacillus başka bir tür dost bakteridir. Yoğurt, bira, şarap ve çikolata gibi birçok gıdada bulunan Lactobacillus bakterileri, bağışıklık sistemine yardımcı olma ve grip gibi hastalıkları önleme konusunda ün sahibidir. Bazı araştırmalar Lactobacillus'un kanserle savaşma özelliklerine de sahip olduğunu gösteriyor. Lactobacillus'un hayvanlara verildiğinde tümör büyümesini inhibe ettiği gösterilmiştir.
Sindirim sistemindeki bazı bakterilerin çok dostça olmaları ve çok fazla hasara yol açmaları nedeniyle bir ünü vardır. Örnekler Vibrio kolera , Clostridium botulinum ve birkaç Salmonella bakteri tipini içerir. Bu bakterilerin neden olduğu hastalıklar bazen ölümcül olabilir.
Kolera kaynağı Vibrio kolera , içme suyuyla yayılabilir. Belirtileri arasında ishal ve dehidratasyon bulunur ve ciddi dehidratasyon bu hastalıktan en yaygın ölüm nedenlerinden biridir. Clostridium botulinum , ishal ve kusmaya ek olarak kas felci, bulanık görme ve solunumsal rahatsızlığı başlatabilen toksinler salgılayarak çok ölümcül hastalık botulizmini yaratır. Salmonella zehirlenmesi, enfekte yumurta, et ve işlenmiş yiyecekleri yemekten kaynaklanan kusma ve ishaza neden olur. Bu bakteri kendi kendini sınırlayan bir hastalık yaratır, bu da vücudun genellikle hastalıkla kendi başına savaşacağını gösterir.
