Her biri, sindirim sistemindeki farklı noktalarda bulunabilecek farklı yiyecek parçalarını parçalamak için tasarlanmış birkaç tür sindirim sistemi enzimi vardır. Ana enzim kategorileri, amilaz, lipaz, proteaz ve nükleazdır. Ağızdaki, midedeki, ince bağırsaktaki ve pankreastaki bezler, yiyeceklerin sindirim kanalından geçerken vücuttan ayrılıp vücut tarafından kullanılması için bunların bir kısmını veya tamamını salgılar. Sindirim enzimlerinin çoğu pankreas suyunda bulunur, ancak tükürük ve mide sindirim sularında da bulunurlar.
Sindirim işlemini başlatan ilk sindirim sistemi enzimlerinden biri, amilazdır. Bu enzim türü karbonhidratları vücudun işleyebileceği basit şekerlere ayırmak için tasarlanmıştır. İlk önce meyveler, sebzeler ve fasulye gibi yiyecekleri sindirmeye başladığı tükürük bezleri tarafından ağzına salgılanır. Daha sonra pankreas tarafından daha fazla amilaz üretilir ve karbonhidratların parçalanmasına yardımcı olmaya devam ettiği ince bağırsaklara gönderilir. Her biri belirli karbonhidrat türlerini işlemek için tasarlanmış birkaç amilaz alt kategorisi vardır; örneğin, laktaz süt şekerlerini, sükraz ise karmaşık nişastaları ve şekerleri parçalamaktadır.
Proteaz, et, fındık ve peynirlerde bulunan proteinleri parçalayan sindirim sistemi enzimleri grubudur. Mide ve pankreas proteaz yaratır, böylece proteinlerin işlenmesi sindirim sistemine karbonhidratlardan daha fazla başlar. Protein, tüm hücrelerin çalışması için kritik olan amino asitlere bölünmelidir. İnsan vücudunda bulunan başlıca proteaz tipleri pepsin ve peptidazdır.
Sindirim sistemi enzimlerinden bir diğeri lipazdır. Lipazın işlevi, yağlarda, etlerde ve süt ürünlerinde bulunanlar gibi yağları parçalamaktır. Bazı lipazlar ağızda ve midede üretilir, ancak çoğu pankreastan gelir ve çalışmalarını ince bağırsakta yapar. Burada karaciğer tarafından üretilen, büyük yağ moleküllerini emülsifiye eden ve onları daha küçük yapan safra ile birlikte çalışır, böylece lipaz daha sonra gliserol ve yağ asitlerine daha da bozabilir.
Pankreas ayrıca sindirim sistemi enzimlerinin sonunu, nükleazı da üretir. Bu enzim, DNA ve RNA gibi nükleik asitleri parçalamak için yapılır. Daha sonra azot ve basit şekerler salıveren nükleotitler arasındaki bağları ayırmak için hareket eder.
