Somatik hipermutasyon (SHM), daha önce hiç karşılaşmadığı antijenleri tanımak için bağışıklık sisteminin uyum sağladığı bir mekanizmadır. Bu mekanizma insanlarda baskın olan yöntemdir ve immün sistem hücrelerinin, immünoglobulin genlerinin değişken bölgelerinde mutasyonu teşvik ederek reseptörlerini çeşitlendirmelerini sağlar. Bu bölgeler, antikor-antijen bağlanma bölgelerini oluşturur ve her bir antikorun özgüllük yeteneklerine katkıda bulunur, bu da spesifik antijen tanımaya izin verir.
Bir mikrop gibi yabancı bir antijen bağışıklık sistemi ile temas ettiğinde, B hücreleri tarafından yabancı olduğu tespit edilir. B hücreleri daha sonra aktive edilir ve çoğalmaları için uyarılır. Bu çoğalma sırasında, immünoglobulin değişken bölge DNA'sı normal mutasyondan yaklaşık 10-15 kez daha hızlı, çok yüksek oranda kopyalanır ve çevrilir. Bu somatik hipermutasyon, etkili bir bağışıklık sistemi için gerekli olan hızlı bir tepkiye izin verir.
Somatik hipermutasyonun, DNA'daki sitozin bazının aktivasyonla indüklenen deaminaz (AID) ile deaminlenmesi, deoksisitidinden deoksiürasile dönüştürülmesi ve yeni DNA ile sonuçlandığı düşünülmektedir. Bu yeni DNA, bir urasil-guanin uyumsuzluğu içerir, çünkü urasil normal olarak adenin ile eşleştirildiği RNA'da meydana gelir ve guanin normal olarak DNA'daki sitozin ile eşleştirilir. Bu mutasyonun düzeltilmesi, yüksek kalitede bir DNA onarım enzimi, uracil-DNA glikosilazı (UNG2) çıkarılması ve ardından yeni DNA iplikçiklerinin DNA polimerazı tarafından sentezlenmesi ile gerçekleşir. Bununla birlikte, bu işlem hataya açıktır ve orijinal deaminasyon bölgesinde veya bitişik baz çiftlerinde hatalı nükleobazların ikame edilmesine neden olabilir. Bu, ekleme ve silme mutasyonlarına karşı hassas olan bir "sıcak nokta" oluşturur.
Somatik hipermutasyonun sonuçları daha sonra kopyalanır ve çevrilir, bu da hipermatlanmış bölgeler tarafından kodlandığı gibi çeşitli reseptörler ve özgüllükler taşıyan çok sayıda B hücresi ile sonuçlanır. İlk olarak proliferasyonu stimüle eden antijene karşı en büyük afinitesi gösteren antikorlara sahip olan B hücreleri, daha sonra karşılık gelen, afinite spesifik antikoru ve aynı zamanda hafıza B hücrelerini üretecek olan plazma hücrelerine farklılaşacaktır. Bu farklılıklar ve afinite olgunlaşması daha sonra antijen gelecekte karşılaşılırsa bağışıklık sisteminin daha etkili ve daha etkili bir cevap vermesini sağlar.
Somatik hipermutasyon, bireysel immün hücrelerde meydana gelir, bu yüzden sadece o belirli bir hücre çizgisinde iletilir. Ayrıca, mutasyonlar herhangi bir yavruya aktarılmaz. Bununla birlikte, problemler ortaya çıkabilir, çünkü somatik hipermutasyon aynı zamanda organizmaların kendi hücrelerine karşı otomatik olarak seçilen hücreleri de içerir. Bu süreçte bir başarısızlık varsa, otoimmün bir tepki kışkırtılabilir.


