Yiyecek sindirildiğinde mideden ince bağırsağa, sonra kalın bağırsağa geçer. Yol boyunca, çeşitli asitler ve diğer maddeler, yiyecekleri parçalamak için etkileşime girer ve vücudun sağladığı besinleri emmesini sağlar. Hem pankreas hem de karaciğer duodenumdaki ince bağırsaklara bağlanır, bağırsaklara safra, insülin ve glukagon gibi önemli maddeler eklenir. Duodenumun ikinci yarısı boyunca ana duodenal papillada bulunan bağırsaklara bağlandıkları noktaya vater ampulla denir.
Ayrıca hepatopankreatik ampulla olarak bilinen Vater'in ampullası, safra kanalından safrayı, pankreastan pankreas kanalından salgılananları ince bağırsaklara taşır. Birkaç sfinkter, salgıların doğru yere yönlendirilmesini sağlar ve ince bağırsağın içeriğinin ampulla içinden geri akmasını önler. Safra kanalı ve pankreas kanalı, sıvı akışını kontrol etmek için sfinkterlere sahiptir. Bir başka sfinkter, hepatopankreatik sfinkter, sıvının hareketini vater bülbülünden geçirir. Bu sfinkter, Oddi'nin sfinkteri olarak da bilinir.
Sindirim sistemi boyunca sorunsuz akmayan sekresyonların bir sonucu pankreatit olabilir. Bu hastalık, vater ampulla gibi bir safra taşı gibi bloke olduğunda ortaya çıkabilir. Vater ampulülü bloke edildiğinde, insülin ve glukagonu içeren pankreas tarafından üretilen sindirim suları duodenum yerine pankreasın içinde aktive olur. Pankreastaki hücreler daha sonra tahriş olur ve iltihaplanmaya neden olur. Pankreatit, pankreas iltihabına atıfta bulunur ve çeşitli başka nedenlerle de takip edilebilir. Semptomları karın ağrısı, bulantı ve karın bölgesinde bel ağrısına yayılan ağrıyı içerebilir.
Nadiren sarılık ampulünde, sarılık ve ağrı gibi semptomlarla kanser gelişebilir. Çoğu kanserde olduğu gibi erken teşhis, daha yüksek bir iyileşme ihtimaline yol açar. Amerika Birleşik Devletleri'nde bir yılda tipik olarak 2.000'den az vaka teşhis edilir ve bu sayı, teşhis edilen tüm gastrointestinal malignitelerin yüzde birinin yalnızca onda ikisini oluşturur. Bu kanser türü hem erkeklerde hem de kadınlarda eşit sıklıkta meydana gelir ve etkilenen duodenumun bir parçası olduğu gibi kanseri de ortadan kaldırarak tedavi edilir. Vater'in ampulla kanseri genellikle lenf bezlerine metastaz yapar ve beş yıllık hayatta kalma oranı sadece yüzde 40'tır.
