İnsanlarda, ince bağırsak genellikle üç bölümden oluşur; Birincisi, yemek mideden geçerken duodenumdur. Jejunum ve ileum, tipik olarak kanalın içini kaplayan hücre tipleri ile farklılaştırılmış diğer parçalardır. Bu ilk bölüm, genellikle 9.8 ila 11.8 inç (25 ila 30 santimetre) uzunluğunda bir tüp benzeri yapıdır. Genellikle birkaç katmandan oluşur. Duodenumun histolojisi ayrıca Brunner bezleri adı verilen ve mide asitlerini nötralize eden mukus salgılayan mikroskopik yapılarla da karakterize edilir.
Yiyecekler genellikle yemekten dört saat sonra organa girer. Küçük kanallar, pankreas enzimlerinin ve safranın içeri akmasına izin verir, bu da asitleri nötralize eder, ayrıca sindirime yardımcı olur. Duodenumun histolojisi tipik olarak, özellikle tipik olarak dairesel veya enine kıvrımlardan oluşan mukoza tabakasında katlanmış bir yapıyı temsil eder. Aynı zamanda 0,05 inç (1 milimetre) uzunluğa sahip villi adı verilen projeksiyonlar da var. Çekirdeğinde lenf ve kan damarları ile sinirler bulunur.
Genellikle villinin içinde, mikrovilli adı verilen hücrelerin kıl benzeri kısımlarından oluşan fırça kenarlığı adı verilen mikroskobik bir katman bulunur. Yiyeceklerin tüpten geçmesine yardımcı olmak için mukoza salgılayan goblet hücreleri de vardır. Mikro katlı hücreler ayrıca oniki parmak bağırsağı histolojisini de oluşturur; normalde antijen sunarak işlev gösterir ve bir dizi lenfatik nodül dizir. Lenfositler adı verilen hücreler, genellikle bağ dokulardan oluşan lamina propria adı verilen daha derin bir tabakada bulunur. Lenfatik yapılar belli bölgelerde yoğunlaşırken, bağırsaklara tipik bezler de bu tabakada bulunur.
Liberkuhn Kriptoları adı verilen bağırsak bezleri, duodenumun iç yüzeyinde genellikle tüp şeklindedir ve açıktır. Genellikle mukoza ve diğer endokrin salgılayan hücreler de vardır. Submukoz tabakası tipik olarak sadece duodenum histolojisinde bulunan Brunner bezlerinin yeridir. Genel olarak sargılı, dallanmış bir boru şeklindeki şekil ile tanımlanır, bunlar mukoza salgılayan hücreler ile kaplanır ve tipik olarak bağırsak bezlerine yol açan kanallarla bağlanır.
Dairesel bir tabaka ve boyuna bir kas tabakası, genellikle musküleris olarak adlandırılan duodenum histolojisinin önemli bir bölümünü oluşturur. Dış tabaka tipik olarak ince bağırsakta bulunanlara tipikken, serosa genellikle duodenumun dış kısmını oluşturur. Bu tabaka ayrıca peritonun veya karın organlarını çevreleyen dokunun bir bileşenidir.
