Sindirim sistemi ve insan vücudunun homeostazı ayrılmaz bir şekilde ilişkilidir, çünkü insanlar sindirim heterotroflarıdır, yani vücudun bir dış beslenme kaynağını özümseyecek bir mekanizmaya sahip olması gerektiği anlamına gelir. Sindirim sistemi ve homeostaz regülasyonunun başarılı olabilmesi için, yenen gıda maddelerinin temel besin maddelerinin rafine edilmesi ve manipüle edilmesi ve sindirim sisteminin yapısının yıpranması ve gerektiğinde onarılması ve yenilenmesi gerekir. Ek olarak, her vücut sistemi dokuları onarmak, inşa etmek ve bakımını yapmak için besin maddelerinin parçalanmasına ve asimilasyonuna bağlıdır. Çok sayıda kimyasal, mekanik ve enzimatik işlem, sindirim sistemi homeostazından sorumludur.
Sindirim, vücutta yiyecekleri vücut hücreleri için kabul edilebilir bir yakıta parçalayan taşıyıcı benzeri bir organ sisteminde vücutta hareket ettikçe vücut tarafından gerçekleştirilir. İşlem, enzimler ilk tükürük yoluyla verildiğinde ağızda başlar. Sindirim sistemi ile homeostaz arasındaki en hayırlı bağlantılardan biri, sindirim sisteminde hidrojen (pH) dengesi potansiyelinin korunmasıdır. Sindirim sistemindeki homeostaz, vücudun pH'ı, sadece hafif asitli olan tükürükten dramatik bir şekilde pH'ı önemli ölçüde değiştirme kabiliyetiyle, yiyeceği hızla parçalayan ve vücudu bakterilerden ve diğer patojenlerden koruyan yüksek asitli bir gastrik ortama ulaşır. Daha da çarpıcı olanı, ince bağırsakta, barsaklara özgü enzimlerin düzgün çalışması için gerekli olan önemli ölçüde bazik bir ortama pH değişimidir.
Sindirim sistemi ile vücuttaki homeostaz arasındaki diğer bir ilgili bağlantı, yararlı bakteriler için misafirperver bir atmosfer sağlamaktır. Dengeli bir enzim oranının sürdürülmesi gibi diğer faktörlerle birleştirilmiş pH'nin düzenlenmesi, asidophilus ve bifidobacterium gibi yararlı bağırsak florasının, vücudun potansiyel olarak yaşamı tehdit eden enfeksiyon ve hastalığa neden olabilecek daha az arzu edilen bakteriyel kolonilerle savaşmasına yardımcı olmasını sağlar. Yararlı bakteriler, bazı kanserojenleri ve kansere neden olduğu gösterilen ilaç metabolitlerini, vücuttaki genel homeostatik durumun şiddetli bir şekilde bozulmasıyla yayılan bir hastalık olan parçalama yeteneğine sahiptir. Yararlı bakteriler ayrıca vücudun kendi üretemediği K vitamini ve diğer çeşitli biyolojik maddeleri de üretir.
Uygun bir enzim, bakteri ve pH dengesine sahip olmak çoğu sağlık uzmanı tarafından sindirim sistemi ve homeostaz arasındaki ilke bağlantı olarak kabul edilir. Bu koşulları teşvik eden yaşam tarzı seçimleri yapan hastaların sağlıklı bir vücut ağırlığını korumaları ve iyi beslenmeleri daha olasıdır. Kanser ve diyabet gibi ciddi hastalıklardan muzdarip olmaları daha az olasıdır.
