Jeomanyetik bir fırtına olarak da bilinen manyetik bir fırtına, Dünya'nın manyetik alanında, koronal kütle çıkışlarından (CME'ler) veya Güneş'ten gelen güneş patlamalarından kaynaklanan bir rahatsızlıktır. Manyetik bir fırtına genellikle güneş olayından 24 ila 36 saat sonra başlar, bir güneş rüzgarı şok dalgası Dünya'nın iyonosferine ulaştığında. Manyetik fırtına daha sonra tipik olarak 24 ila 48 saat sürer, ancak bazıları günlerce sürebilir. Manyetik bir fırtınanın etkileri arasında iletişim ve navigasyon sistemlerinin bozulması, yoğun auroralar, uyduların zarar görmesi ve en şiddetli fırtınalar sırasında, elektrik hatlarında ve boru hatlarında elektrik kesintileri ve korozyona neden olan akımlar meydana gelir.
Ciddi manyetik fırtınalar her on yılda bir gerçekleşir ve en şiddetli olanı her yüzyılda bir meydana gelir. Bir güneş fırtınasından gelen enerjik parçacıklar iyonosfer ve manyetosfer ile çarpıştığında meydana gelir, bir enerjik parçacıklar dizisi oluşturur ve atmosferin manyetik ve elektrik akımlarını rahatsız ederler. Son iki yüzyılda, 28 Ağustos - 2 Eylül 1859 tarihlerinde kaydedilen en büyük ve 13 Mart 1989'da gerçekleşen fırtına dahil olmak üzere iki ciddi manyetik fırtına yaşandı.
28 Ağustos - 2 Eylül 1859 tarihlerinde manyetik fırtınada, auroralar Meksika, Küba, Havai ve İtalya kadar güneyde görüldü. Avrupa ve Kuzey Amerika'daki telgraf telleri kısa devre yapmış, bazıları yangına neden olmuş. Jeomanyetik fırtınayı tetikleyen şok dalgası gelmeden 18 saat önce Güneş'te aktif güneş lekeleri gözlendi. Bu, jeomanyetik bir fırtınanın önceden tahmin edildiği ilk zamanlardan biri. Olay, 1859 güneş süper fırtınası olarak bilinir.
13 Mart 1989'da meydana gelen daha yeni bir manyetik fırtına, genel olarak daha büyük bir altyapıya sahip olmasının yanı sıra, uydular da dahil olmak üzere hassas elektroniklere olan bağımlılığın artması nedeniyle dünyanın altyapısına daha fazla zarar veriyordu. Manyetik fırtına, Hydro-Québec güç şebekesinin birkaç saniye içinde çökmesine neden oldu, tellerdeki indüklenen akımlar trafo çekirdeğini ve kızartılmış koruyucu ekipmanı patlattığında, altı milyon insanın dokuz saat boyunca güç kaybına neden olan bir zincir reaksiyonu ortaya çıktı ve önemli ekonomik hasar. Toronto Borsası manyetik fırtınanın yol açtığı bilgisayar hasarı nedeniyle geçici olarak kapatıldı. Yörüngedeki birkaç uydu, birkaç milyonlarca dolara mal oldu.
Manyetik bir fırtına, korunmasız astronotlar için, özellikle Dünya'nın manyetik alanındaki uyarılmış akımdan değil, doğrudan Güneş'ten gelen enerjisel parçacıklar nedeniyle tehlikeli olabilir. Şiddetli bir fırtına sırasında Ay'ın yüzeyinde geleneksel bir uzay giysisine sahip bir astronot, ölümcül bir doz olan 7000 rem radyasyon alabilir. Eğer astronot uyarılır ve ay toprağının altına gizlenirse, etki minimum düzeyde olur.
