Mikroarray nedir?

Bir mikro dizi, kolay eşzamanlı analiz için bir dizi üzerinde düzenlenmiş bir DNA, protein veya doku nokta dizisidir. En ünlüsü, gen ekspresyonu profillemesinde ayrılmaz bir rol oynayan DNA mikrodizidir. Substrat malzemesi cam, plastik veya silikon bir çiptir. DNA mikroarray için alternatif isimler gen çipini , DNA çipini ve biyoçip'i içerir . DNA'nın küçük parçalarına prob denir.

Bir mikro dizi, çeşitli şekillerde yapılabilir. En ilkel, pimleri kullanarak DNA'yı yalnızca cam slaytların üzerine bırakmaktır. Daha karmaşık teknikler fotolitografi, elektrokimyasal yaklaşımlar ve hatta mürekkep püskürtmeli baskı kullanmaktadır - DNA'yı kesin bir noktaya tam olarak ulaştırabilen herhangi bir şey.

DNA mikro-dizisi, 1980'lerin sonlarında ve 1990'ların başında, biyoteknolojinin gerçekten ortaya çıkmaya başladığı bir üründür. Mikrodizi, bir araştırmacının tüm numuneler üzerinde aynı anda bir dizi test gerçekleştirmesini sağlayarak araştırmayı önemli ölçüde hızlandırır. Geleneksel biyolojik deneyler, her seferinde bir şey üzerinde çalışır. Problar bazen kolayca ayırt edilemediklerinde florofor adı verilen noktalarla işaretlenir.

NimbleGen Systems gibi şirketler tarafından yapılan en büyük mikrodizilerden bazıları 390.000 nokta içeriyor. Mikro dizi, her biri kendi DNA ve RNA'larına sahip düzinelerce kromozom veya daha fazlasını içerebilen bir organizmanın tüm genomunun analizinde sıklıkla kullanılır. Ne yazık ki, tüm mikroarray'ler birbirleriyle uyumlu değildir ve açıkça bir standart eksikliği vardır. Standardizasyon çalışmaları devam etmektedir, ancak henüz bir başarı elde etmemiştir.

En son biyoteknoloji araştırma gündemlerinin çoğu gibi, mikro dizi üzerinde yapılan testler de, her şeyi anlamayı amaçlayan biyoinformatik alanına yol açan çok miktarda veri üretebilir. Daha önce ölçtüğümüz keşifler ve korelasyonlar olabilir, ancak verilerin taşması nedeniyle farkedilmemiş olabilir. Veri madenciliği bu karmaşık deneylerin sonuçlarını analiz etmek için yoğun olarak kullanılmaktadır.