Peptid Dizisi Nedir?

Peptitler, ana elemanları karbon (C), hidrojen (H), oksijen (O) ve azot (N) olan amino asitlerin bağlanması ile oluşturulan biyolojik polimerlerdir. "Peptit dizisi" terimi, amino asitlerin bağlanma sırasını belirtir. Peptitler canlı sistemlerde çok önemlidir ve protein adı verilen çok daha büyük zincirler oluşturmak için birleşirler. Birçok biyolojik peptit çeşidi olmasına rağmen, bunların çoğu sadece 20 amino asitten oluşur. Proteinler, enzimler ve bitkilerde ve hücre hücrelerinde hücre duvarlarının yapısında hayvan hücrelerinde bulunan çeşitli biyolojik işlevleri yerine getirir.

Amino asitler, amin (-NH2) ve karboksilik asit (-C02H) gruplarına sahip oldukları için adlandırılır. Biyolojik sistemlerde bulunan amino asitlerin çoğu R-CH (NH2) -C02H genel formülüne sahiptir, burada R bir grup gruptur. R'nin değişken yapısı, peptidlerin ve proteinlerin yapısını ve özelliklerini etkileyen şeydir.

Peptit sentezi, bir amino asidin amin grubu, başka bir amino asit üzerindeki karboksilik asit grubuyla reaksiyona girdiğinde meydana gelir. Sonuç, nitrojen-karbon bağı bir peptit bağı olarak adlandırılan -N (H) -CO- yapısının bir amid grubunun oluşturulmasıdır. Reaksiyon, her biri bir amid grubu ile serpiştirilmiş farklı fonksiyonel gruplardan oluşan bir peptid sekansı oluşturmak için herhangi bir sayıda gerçekleştirilebilir.

Peptitler ve proteinler farklı yapı seviyelerine sahiptir. Birincil protein yapısı, amino asitlerin bulunduğu sıradır; bu onun peptid dizisidir. Protein üzerindeki fonksiyonel gruplar, bir şekle sokmak için birbirleriyle etkileşime girer. Bir peptidin ayrı ayrı bükülmesi ve dönüşü, ikincil yapısı olarak adlandırılır. Genel şekli, tüm bu bükülme ve dönüşlerin net sonucu, peptidin üçüncül yapısıdır.

Proteinlerin veya peptitlerin biyokimyasal özellikleri, üçüncül yapıya bağlıdır. Tüm kimyasallarda olduğu gibi, proteinler enerjik açıdan en uygun şekli alacaktır. Bu şekil, ayrı ayrı amino asitler üzerindeki gruplar arasındaki çekici ve itici güçlerden kaynaklanmaktadır. Bu nedenle, üçüncül yapı birincil yapıdan kaynaklanmaktadır, yani belirli bir proteinin peptid dizisinin çıkarılmasının sonuçta özelliklerini açıklayacağı anlamına gelir.

Bir proteinin peptid dizisinin işlenmesi, ilaç tasarımında uygulamalara sahiptir. Biyolojik işlemlerin çoğu, proteinlerin etkilerine dayanır ve ilaçlar genellikle bu proteinlerin etkilerini kopyalayarak veya bloke ederek çalışır. Proteinlerin davranışını anlamak daha etkili ilaçların tasarımına yol açabilir. Bu nedenle, bir ilaç firmasının araştırma ve geliştirme departmanı tipik olarak yeni ilaçlar arayışında kullanacağı bir peptid kütüphanesine veya peptit kataloguna sahiptir.