Transkriptom Nedir?

Transkriptom, bir organizmadan, bir grup hücreden veya hatta belirli bir hücreden tam bir RNA topluluğudur. RNA, DNA'dan transkripsiyon olarak bilinen bir işlemle sentezlenir. Bir hücrede ve vücutta mevcut olan RNA, hangi genlerin eksprese edileceğini belirler ve statik kalan DNA'nın aksine bir organizmanın yaşamı boyunca değişir. Çevresel baskı, vücut kendini sürekli çalışır durumda tutmak için değişen çevresel koşullara uyum sağlamaya çalıştığından, değişikliklerin başlıca nedenlerinden biridir.

Transkriptom, bir organizmanın genomundan, organizmada DNA'nın tamamen toplanmasından çok daha küçüktür. Basit bir ifadeyle, DNA bir yemek kitabı olarak düşünülebilir, yapılabilecek tariflerin eksiksiz bir koleksiyonunu listeleyebilirdi. Transkriptome, hangi tariflerin ne zaman ve ne zaman yapılacağını belirleyen koddur. Yemek kitabı yaşam boyunca sabit kalırken, transkriptom çevresel faktörlere cevaben değişir.

Transkriptomun önemli bir parçası mRNA molekülleridir. Messenger RNA, hücreleri çeşitli proteinler yapmak üzere yönlendirmek için hücrelerdeki ribozomlarla iletişim kuran RNA'dır. Bu proteinler çok çeşitli işlevler için kullanılır. Diğer kısımlar doğrudan protein üretimini kodlamayabilir, fakat hücre yapısını belirlemek ve gen ekspresyonunu düzenlemek gibi şeyler yapar. Birlikte, transkriptomun çeşitli bileşenleri bir organizmayı çalışır durumda tutar ve bu organizma içindeki gen ekspresyonunu belirler.

Vücuttaki çeşitli hücrelerde, transkriptome çok farklı olabilir. Örneğin karaciğer hücreleri, onları karaciğer hücreleri yapan RNA'ya sahiptir ve hücrelerin gerekli işlevleri gerçekleştirmesini sağlar. Öte yandan cilt hücreleri, bir hücreyi cilt hücresi yapmak için gereken genleri aktive eden farklı bir transkriptoma sahiptir. Hem karaciğer hem de cilt hücreleri genomun tam bir kopyasına sahiptir, ancak transkriptomları genomun hangi kısımlarının aktif olduğunu belirler.

Aynı DNA'da olduğu gibi, RNA sıralamak da mümkündür. Transkriptom dizilimi, bir hücrenin ve konakçı organizmanın DNA'sının hareketleri hakkında daha fazla bilgi edinmek ve genetik bilginin ifadesinin yanlış gittiği yerleri belirlemek için yapılabilir. Örneğin bir karaciğer hücresi malign hale geldiğinde, örneğin, transkriptomun olması gerektiği gibi işlememesi ve malignite için genlerin aktif hale gelmesi veya hücrelerin bir şekilde regülasyondan yoksun olması ve bunların kontrolden çıkmalarına neden olmasından kaynaklanmaktadır. RNA'nın bir malign hücrede sekanslanması bir araştırmacının, maligniteye neden olmak için hangi genin aktif olduğunu veya inaktive olduğunu bulmasına yardımcı olabilir.