Endopeptidaz Nedir?

Bir endopeptidaz, proteinleri parçalayan büyük bir gruptan bir enzim olan bir proteaz türüdür. Enzimler, reaksiyonları çok daha hızlı gerçekleştiren proteinlerdir. Proteinler, peptit bağları ile bağlanmış amino asit zincirlerinden oluşur. Bu bağlantı, bir amino asidin karboksil terminalini, diğerinin amino terminaliyle birleştirir. Endopeptidazlar, protein sonunda amino asitlerin peptid bağlarını, proteinin uçlarında parçalanan ekzopeptidazların aksine ayırır .

Endopeptidazlar bütün organizma sınıflarında bulunur ve çok çeşitli biyolojik aktivitelere sahiptir. Gıdalarda protein sindirimine katılırlar. Bu, pepsin, tripsin ve kimotripsin enzimlerini içerir. Proteazlar ayrıca antikorlar veya hormonlar gibi diğer proteinleri parçalayarak hücresel sinyalleşmeye de katılır. Yolları açıp kapatabilirler.

Proteazlar genellikle ilk önce aktif olmayan daha büyük bir molekül olarak yapılır. Bu, sentezleyen hücreyi hasar görmekten korur. Proteaz, örneğin mideye hedefine ulaştıktan sonra, molekülün bir kısmı uzaklaştırılır. Bu proteaz aktive eder.

Hücresel fonksiyondaki sayısız rolleri nedeniyle, endopeptidaz aktivitesine çok fazla tıbbi ilgi vardır. Bunun bir örneği, özellikle amino asit prolininden sonra parçalanan prolil endopeptidazdır. Depresyon, mani ve şizofreni gibi psikolojik bozukluklarla ilişkilendirilmiştir. Prolil endopeptidaz inhibitörlerine olası anti-depresanlar olarak klinik ilgi vardır.

Başka bir örnek, birkaç başka adı olan nötr endopeptidazdır. Aynı zamanda neprilisin ve yaygın akut lenfoblastik lösemi antijeni (CALLA) olarak da bilinir. Bu proteaz, Alzheimer Hastalığının bir nedeni olarak belirtilen peptit ve birkaç önemli sinyal peptidi dahil olmak üzere küçük salgılanan peptitleri indirgemektedir. Nötr endopeptidaz bazen bir kanser markeri olarak kullanılır, ancak kanserdeki rolü belirsizdir. İnhibitörler ağrı kesici ve yüksek tansiyon kontrolüne yardımcı olmak için geliştirilmiştir.

Endopeptidazlar, aktif bölgelerinin yapısına ve tercih ettikleri koşullara bağlı olarak farklı ailelere yerleştirilir. Aktif bölgelerinde amino asit serin olan serin proteazlar vardır. Bu ailenin üyeleri arasında, prolil endopeptidaz ile birlikte, tripsin ve kimotripsin sindirim proteazları bulunur. Biyokimyasal araştırma laboratuvarlarında sıkça kullanılan bir inhibitör, oldukça toksik bileşik olan fenilmetansülfonilfloürürdür (PMSF). Protein izolasyonu ve saflaştırma sırasında, saflaştırılmış proteini bozabilecek serin proteaz aktivitesini inhibe etmek için kullanılır.

Sistein proteazları aktif bölgelerinde bir kükürt grubuna sahiptir ve meyvelerde yaygındır. Bu enzimler et yumuşatıcılarında bulunur. Papain, böyle bir endopeptidazın bir örneğidir ve arı ve yaban arısı sokmaları tedavisinde kullanılır.

Aspartik proteazların aktif bölgesi genellikle iki aspartat grubu içerir. Metalloendopeptidazlar, etkinlik için metal bir kofaktör gerektirir. Nötr endopeptidazlar, bu ailenin bir parçasıdır ve aktivite için çinko gerektirir.