Genom Annotation Nedir?

Genom notu, bir genomun bölümlerini içerdiği genetik veriler hakkında bilgi ile etiketler. Bu, hedefin yalnızca hedef organizmanın DNA'sını dizmek değil, ne yaptığını ve nasıl çalıştığını anlamak olduğu genom projelerinde de sürecin bir parçasıdır. Araştırmacılar laboratuvarlarında ek açıklamalar yapabilir ve kaynakları ve bilgileri bir araya getirmek için verileri diğer bilim insanlarıyla paylaşabilir. Halka açık çevrimiçi veritabanları mevcuttur ve bazıları genel halk üyelerine kendi ek açıklamalarını göndermelerine izin verir.

Genom açıklamalarındaki ilk adım, araştırmacıların bir organizmanın DNA'sındaki amino asitlerin sırasını belirlediği sıralamadır. Bütün bir genomun sıralanması uzun zaman alır ve genomun kodu çözülmeden önce bilim adamlarının açıklamaya başlaması yaygındır. Sıralı DNA'nın bir kısmı el ile, bir araştırmacı not eklemeye başlayabilir. Bilim adamları, genomun nerede başladığını ve durduğunu, genomun işlevi hakkında bilgi içeren kendine özgü DNA dizgilerine dikkat ederek dikkatlerini çekebilir.

Bilgisayarlar bazı genom açıklamalarını kendi başlarına yapabilirler. Genlerin başında ve sonunda ortaya çıkan amino asit dizileri gibi bilinen desenleri arayabilirler. Otomatik bilgi notunda, bilgisayar, onun hakkında bilgi vermek için bir DNA dizisinin farklı bölümlerine notlar ekleyebilir. Türler hakkında bir bütün olarak önemli bilgiler sağlayabilecek varyans aramak için farklı organizmalardan segmentleri karşılaştırmak da mümkündür.

Manuel genom notu, DNA'nın fiziksel olarak incelenmesini içerir. Birçok araştırmacı, bilgileri görüntülemek ve etiketlemek için bilgisayarları kullanır ve çalıştıkları sırada veritabanlarına girmelerini sağlar. Bazı durumlarda, bilgisayarın bilgileri doğru aldığından emin olmak için otomatik açıklamadan sonra manuel inceleme gerekebilir. Bu özenli bir işlem olabilir ve araştırmacılar veritabanlarını havuzlamaktan hoşlanan sebeplerden biri olan hatalar ortaya çıkar. Bir ek açıklama DNA'nın aynı bölümünde başkalarıyla eşleşmezse, insanlar ne olduğunu belirlemek ve hatayı düzeltmek için bilgileri değerlendirebilir.

Genom ek açıklama işlemi sırasında bir genin ne yaptığını belirlemek her zaman mümkün değildir. Bilim adamları genleri işaretleyebilir ve bunları tekrarlayan kodlayıcı olmayan DNA gibi genomun diğer bileşenlerinden ayırabilir. Bu bilgi araştırmada, insanlar genomun farklı bölümleri hakkında teoriler geliştirdikçe kullanılabilir. Bir genin fonksiyonunu not etmek için açıklamalara ekleyebilirler.