Peptit bağlanması, bir peptid zinciri olarak da bilinen amino asitlerdeki polipeptit ve protein molekülleri arasındaki bir amid bağıdır. Kovalent bir bağ, peptit bağlanmasının karakteristiğidir ve normal peptid sentezi için gereklidir. Başka bir deyişle, peptid bağları amino asitleri protein polimerleri yaratan belirli bir sıraya bağlar ve eşsiz, üç boyutlu (3B yapıların oluşumunu yönlendirir).
Moleküler kimya açısından, iki veya daha fazla amino asidin bağlanması bir peptid molekülü oluşturur. Peptit bağı, bir karboksilik asit molekülünün, bir sonraki amino asit molekülündeki bir amino grubuyla tepkimeye girdiği yerde oluşur. Elde edilen molekül bir dipeptittir - peptid bağlanmasıyla birbirine bağlanmış iki amino asit. Peptid bağları bağlandıkları amino grubuna özgüdür.
Peptit sentezi veya protein sentezi işlemi, çeşitli ribonükleik asit (RNA) moleküllerinin (haberci, ribozomal ve transfer RNA - ve amino asitleri) bir peptid zincirinin ve bir dizi biyokimyasal reaksiyonun oluşumunu içerir. Protein sentezi, ribozom, haberci RNA'yı (mRNA) dönüştürdüğü zaman gerçekleşir ve çeviriden sonra iki amino asit molekülü arasında bir peptid bağı oluşur. Peptit bağlanması her gerçekleştiğinde, polipeptit zinciri olarak adlandırılan şeye yeni bir amino asit eklenir. Bazı şartlar altında, çoklu ribozomlar aynı mRNA iplikçikini çevirebilir, bu da çift kopya peptit bağlanması ve dolayısıyla çift kopya peptit zincirleri ile sonuçlanır.
Protein sentezi tamamlandığında, polipeptit zinciri enzim katalizli bir reaksiyonla serbest bırakılır ve biyolojik olarak aktif bir protein haline gelen bir 3D yapı oluşturur. Bakteriyel enfeksiyonların tedavisinde kullanılan bazı antibiyotiklerin etkinliği, protein sentezi sırasında peptit bağlanmasına dayanır. Bakterilerin ihtiyaç duyduğu protein oluşumuna müdahale ederek antibiyotikler bakterilerin çoğalmasını durdurabilir.
Peptit bağlanmasını önleyen antibiyotikler de protein sentezini inhibe eder. Pek çok antibiyotik özellikle sağlıksız hücreleri hedef alamamaktadır, bu nedenle süreç sırasında sağlıklı hücreleri etkilemektedir, ancak bakteri ribozomlarını hedef alarak sadece bakteri hücrelerinde etkili olan bazı ilaçlar vardır. Antibiyotikler için etki mekanizması, peptit bağı oluşumunu inhibe ederek RNA'nın transkripsiyonunu veya peptit zincirlerinin büyümesini önleyebilir. Diğer mekanizmalar eksik protein kodlaması ve transkripsiyon RNA'sının (tRNA) önlenmesini içerir, bunların tümü biyokimyasal aracılı peptid bağlanmasına dayanır.
Yeni antibiyotik geliştirme ile yüklenen araştırma ve geliştirme ekiplerinden gelen talep sonucunda peptit sentezi şirketlerine duyulan ihtiyaç ortaya çıktı. Talep edilen peptid hizmetleri, kütle spektrometrisi ile özel sekanslamayı veya bir peptit kataloğunun veya peptit kütüphanesinin geliştirilmesini içerir. Bu servis sağlayıcıların bazıları ayrıca değiştirilmiş peptidler ve sentez materyalleri sağlarlar.
