Prokaryotik Transkripsiyon Nedir?

Ökaryotik hücrelerin aksine, bir bakteri gibi bir prokaryotik hücre genellikle içinde organeller adı verilen ayrı yapılara sahip değildir. Tipik olarak çekirdek, mitokondri veya ayrı metabolik işlemlerin meydana geldiği başka alanlar yoktur; her şey çoğunlukla hücre duvarı ve plazma zarı içinde serbest yüzer. Ökaryotik hücreler gibi, genellikle transkripsiyon yoluyla kopyalanabilen deoksiribonükleik asit (DNA) ve ayrıca ribonükleik asit (RNA) lifleri vardır. Prokaryotik transkripsiyon tipik olarak, DNA'nın transkripsiyonunu başlatmak zorunda olan prokaryotik RNA polimeraz adı verilen bir enzim tarafından kontrol edilirken, işlemin sonlandırılması genellikle diğer nükleotit sekansları tarafından tetiklenir.

RNA polimeraz enzimi, bir DNA zincirinin uzunluğunu geçtiğinde, onu transkripsiyon bölgesinde çözer ve haberci, transfer ve ribozomal RNA yapılabilir. Prokaryotik transkripsiyonda tipik olarak iki tür enzim vardır; bunlardan biri kopya yapabilen ancak bir gen üzerindeki uygun yeri bulamayan bir çekirdek enzimdir. Molekülün bir holoenzim formu genellikle spesifik bölgede transkripsiyonu başlatabilir ve bu nedenle DNA'yı ne zaman kopyalamaya başlayacağını söyleyen promotör sekansları yerleştirmek için tasarlanmıştır. Holenzim, bu işlevi sigma denilen bir bileşen vasıtasıyla gerçekleştirir.

Prokaryotik transkripsiyon, RNA polimeraz DNA promotör bölgesine bağlandıkça başlar. Kapalı kompleks olarak adlandırılan molekül ve çift sarmallı yapı daha sonra etkileşime girebilir ve DNA, transkripsiyonun başladığı yerin yakınında tek sarmallı bir sekansta açılır. Buna açık kompleks denir. Enzim tipik olarak, transkripsiyon işlemine, kompleksin bir protein tarafından bırakılması engellenen yaklaşık 10 kullanılamaz transkript oluşturarak başlar.

Bu protein salındığında, enzim transkripsiyona devam eder. RNA polimerazı ve proteinlerinin DNA'ya ne kadar güçlü bağlandıkları konusunda bazen farklılıklar vardır; Bu bağın gücü, belli bir tabanın belirli bir lokasyonda bulunmadığı istatistiksel olasılıkla ilişkili olabilir. Bazların bu fikir birliği sırasına ne kadar yakın eşleştiği çoğu zaman bağın ne kadar güçlü olacağını belirler.

Prokaryotik RNA transkripsiyonu genellikle her saniye yaklaşık 40 nükleotitte gerçekleşir. Bazı proteinler bunun gerçekleştiği hızı değiştirebilir ve bazı dizilerin kopyalanma hızı da farklı olabilir. Regülatör genleri sıklıkla hücrenin ihtiyaç duyduğu şeye bağlı olarak sekansların nasıl ifade edildiğini değiştirir. Prokaryotik transkripsiyon, RNA'daki sekanslar moleküler kompleksin ve DNA'nın ayrılmasına neden olduğunda veya spesifik bir protein RNA polimeraz enzimine bağlandığında ve bunlara ulaştığında sonlandırılabilir.