Ribozomal RNA Sıralaması Nedir?

Ribozomal ribonükleik asit (RNA) sekanslaması, ribozomu oluşturan nükleik asitlerin sekans içeriğini belirleme prosesidir. Neredeyse tüm hücrelerde ribozomlar, hücrenin çalışmasını sağlamak için proteinler oluşturan makromoleküllerdir. RNA'dan ve RNA'nın daha verimli çalışmasına yardımcı olan çeşitli proteinlerden oluşurlar. Bir ribozomdaki bu materyalin çoğu doğrudan protein oluşumunda yer alır, bu yüzden ribozomal RNA sekansının belirlenmesi, molekülün son yapısı ve nasıl çalıştığı hakkında fikir verebilir. RNA'nın fonksiyonu ve genel yapısı çeşitli türler arasında iyi korunur, fakat ham dizi değildir ve dizideki değişiklikler ribozomun evrimi hakkında bilgi edinmek için kullanılabilir.

Bakteriyel ribozomlarda veya daha karmaşık organizmalarda kullanılan olsun, ribozomal RNA dizilimi benzer şekilde gerçekleştirilir. RNA ribozomdan ayrıldığında, birçok kez çoğaltılır, daha sonra sekansları kolayca tanımlanabilen küçük parçalara bölünür. Bu küçük sekans parçaları daha sonra yeni belirlenen sekansı üretmek için yeniden birleştirilir. Bir dizi uzadıkça görev daha karmaşık hale gelir, ancak işlem nispeten küçük olan ribozomal RNA için nispeten kolaydır. Ribozomal RNA dizilimindeki ilk denemenin ilk seferinde doğru olacağının garantisi yoktur, bu nedenle genellikle veri kalitesini doğrulamak için çoklu denemeler yapılır.

Ribozomal RNA diziliminden elde edilen veriler çeşitli amaçlar için kullanılabilir, ancak en yaygın olanlarından biri bakteriyel teşhis içindir. Özellikle bakteriyel ribozomal RNA, türler arasında büyük ölçüde korunur, bu nedenle sıralama, bir türün benzersiz özelliklerinin referans için bir profile birleştirilmesini sağlar. Bu profil, belirli bir bakteri türünü hızlı ve kolay bir şekilde tanımlamak için kullanılabilir; bu, hastanın teşhis ve tedavisinde yardımcı olabilecek bir testtir. Daha iyi sıralama teknolojisinin ortaya çıkmasıyla, bu yaklaşım tanılarda daha yaygın hale gelmiştir.

İnsan sağlığına zarar verebilecek ikinci bir etki ribozomal RNA dizilimi, ilaç ve ilaçların tasarımında yardımcı olmaktadır. Bakteriyel ribozomal RNA sekansları, bakterilere özgü birçok alt diziye sahiptir, bu nedenle bu bölgeleri antimikrobiyal ilaçlar ile hedeflemek, insanlara zarar vermeden bakterileri öldürebilir. Ribozomal RNA sekans verilerini kendi başına ilaç oluşturmak için yeterli veri sağlamaz, ancak bilim insanlarına bölgelere gelecekteki çalışma ve ilaç tasarımı için odaklanmalarını sağlar. Dizilere bağlanan ve ribozomu devre dışı bırakan tıbbi moleküller tasarlanabilir. Çeşitli güncel ilaçlar bu tekniği hastalıklarla savaşmak için kullanırlar.