Çok sayıda hayvan, yalnızca veya zamanın bir bölümü olan mağaralarda yaşar. Troglobitler - troglodytes ile karıştırılmaması gereken - bütün hayatlarını mağaraların karanlık kısmında yaşayan hayvanlardır, troglofiller bazen bir mağara dışında ortaya çıkan, ancak içinde derin olan hayvanlardır ve trogloxenler mağaraların içinde hayatta kalabilen hayvanlardır. ama soyu tükenmiş mağara ayıları gibi çoğunlukla dışında bulunurlar. Stygobitler, yer altı sularında mağaralar içinde veya arasında bulunan hayvanlardır. Gerçek troglobitlerin işlevsel gözleri yoktur. Gözleri, deri tabakasının altına örtülmüş, göz alıcı olabilir. Özel mağara hayvanlara mağaracılık denir.
Mağaralarda yaşayan bazı hayvanlar arasında semenderler, Mağarada Yaşayan Sıçan Yılanı, birçok balık, yarasalar ve böcekler, kırkayaklar, hasatçılar, kerevitler, bahar kuyrukları, örümcekler, vb. Dahil olmak üzere birçok eklembacaklılar bulunur. büyük hayvanlardan daha fazladır ve mağaraya özel annelidleri, sülükleri, yumuşakçaları, akarları vb. içerir. Birçok troglobite mağaralardaki gıda kıtlığını hesaba katan yavaş metabolizmalara sahiptir.
Mağaralarda çok fazla zaman harcayan hayvanlar, nihayetinde görme pahasına daha iyi duyma veya hassas titreşimleri algılama yeteneği gibi aşırı çevreye dayanmak için özel uyarlamalar geliştirir. Mağaralarda yaşayan birçok hayvan pigmentlerini kaybeder, hayalet gibi beyazlaşır, zifiri siyahlı bir ortamda pigmentasyonun işe yaramaz olduğunun sinyal rolü olarak. İşleyen gözlerin yokluğuna, çevreyi dokunsal araçlarla araştırmak için kullanılan böceklerdeki uzuvların ve antenlerin uzatılması da eşlik ediyor. Gerçek mağara böceklerinin kanatları da azaltılmış veya yoktur.
Mağara ortamı, olumsuz özelliklerle ayırt edilir: gece veya gündüz, yaz veya kış arasındaki farkın olmaması. Soğuk hava akımları çoğu mağara boyunca akarken, sıcaklık veya nemde çok az değişiklik vardır. Yiyecekler dışarıdan içeri girebilirler; ya yaşayan, sığınacak hayvanlar biçiminde ya da ölü halde, akarsu yoluyla taşınan organik maddelerle. Mantarlar bu organik madde ile beslenirler ve sırayla mantarlar ile beslenirler. Mağaralarda kış uykusuna düşen kelebekler, sırayla yarasalar tarafından yenen çekirgeler tarafından yenir.
Birçok mağara hayvanı, bulundukları mağaraya endemiktir ve bazı durumlarda sadece birkaç mil kareye yayılabilir. Keşfedilmeyi bekleyen daha birçok mağara hayvan var.
