Co je to proteinová interakce?
Interakce proteinu je biologický proces, který zahrnuje vazbu dvou nebo více proteinů. Tyto proteinové vazby jsou nezbytnou součástí buněčných funkcí všech živých organismů a jsou často nezbytné pro to, aby proteiny plnily své specifické funkce. Tyto buněčné operace zahrnují kritické procesy, jako je replikace DNA, která je usnadněna složitými molekulárními strukturami vyplývajícími z proteinových interakcí. Tento proces také tvoří jádro mnoha buněčných mediačních a signalizačních funkcí. Proteinové vazby mohou mít mnoho forem, včetně dlouhodobých komplexních vazeb a krátkodobých vztahů s transportem nebo modifikací proteinu.
Proteiny jsou přirozeně se vyskytující sloučeniny, které sestávají z lineárního uspořádání aminokyselin. Tyto sloučeniny jsou součástí nejzákladnějších a základních biologických stavebních kamenů pro všechny živé bytosti. Tyto stavební bloky vykonávají nesčetné množství kritických funkcí na buněčné úrovni buď samostatně, nebo jako části větších vázaných proteinových skupin. Obecně známé jako komplexy, spojené sloučeniny vytvořené touto proteinovou interakcí jsou zodpovědné za celou řadu kritických buněčných funkcí, jako je replikace DNA, mezibuněčná signalizace, modifikace proteinu a transport. Studium mechaniky proteinových vazeb také neustále zlepšuje schopnost vědců pochopit a bojovat s mnoha chorobami, které nadále trpí morem lidstva.
Jednou z nejvýznamnějších z těchto proteinových interakčních funkcí je signální transdukce. Chemické signály pocházející z vnějšku buňky jsou často zprostředkovány nebo přenášeny dovnitř mechaniky protein / proteinové komplexy. Tyto přenosy signálů jsou kritické pro mnoho buněčných procesů a hrají důležitou roli v progresi chorob, jako je rakovina. Některé vazby na interakci s proteiny plní transportní roli s jedním proteinem, což usnadňuje pohyb jiného z vnějšku buňky do jádra. Opak je také pravdou v případě jaderných pórů, tj. Velkých proteinových komplexů, které se pohybují od středu buňky směrem ven prostřednictvím účinků proteinové interakce.
Další z mnoha základních funkcí interakce proteinu je proces modifikace proteinu kinázy. Tento proces zahrnuje přidání několika fosfátových skupin k jednomu proteinu druhým v komplexu. Tyto modifikované sloučeniny také hrají zásadní roli při zprostředkování mezibuněčného signálu, přičemž přibližně 30 procent všech lidských proteinů je modifikováno kinázou založenou na interakci s proteiny. Jedná se o krátkodobé interakce, někdy až dokončení nanosekund. Jiné procesy vazby na bílkoviny jsou ze své podstaty dlouhodobější a některé dokončení trvá několik hodin nebo dokonce dní.