Wat is een metaboloom?
Een metaboloom is een gedetailleerde afbraak van signaalchemicaliën, metabolieten, hormonen en soortgelijke structuren die in een organisme worden gevonden. Sommige hiervan worden op natuurlijke wijze geproduceerd, anderen door het metabolisme van verschillende ingenomen voedingsmiddelen en drugs. In de loop van zijn leven zal de verzameling chemische verbindingen van een organisme veranderen. Het is mogelijk om op tijd een momentopname te maken om te zien wat een organisme op een bepaald moment bevat en geproduceerd, maar dit zal van moment tot moment veranderen.
De studie van de menselijke metaboloom is een onderwerp van bijzonder belang. Medische testen zijn vaak afhankelijk van metabolieten voor diagnostische doeleinden. Een arts kan controleren op de aanwezigheid of afwezigheid van verbindingen om ziekten in of uit te regeren, of om te zien hoe goed een patiënt op medicijnen reageert. Alleen een fractie is identificeerbaar met medische basistests. Het uitbreiden van het aantal metabolieten die artsen zouden kunnen testen, zou meer mogelijkheden creëren voor nauwkeurige diagnose en testen van patiënten.
Dit biedt een unieke opportunity om interacties tussen genetica en omgeving te bestuderen. De genoomcodes voor de productie van een aantal verbindingen zoals hormonen, enzymen, enzovoort. Fouten kunnen problemen veroorzaken zoals tekortkomingen of defecte chemicaliën. Ondertussen heeft het milieu ook invloed op de metaboloom van een persoon; Wat de persoon eet, drinkt en anders wordt blootgesteld, zal zijn metaboloom veranderen en een andere set kenmerkende chemicaliën creëren.
Onderzoekers met interesse in hoe milieu en genetica kunnen samenwerken, kunnen de metaboloom bestuderen om te kijken naar de kruising van deze onderwerpen. Ze kunnen kijken naar de manier waarop omgevingssilenen wordt beïnvloed of ze bijvoorbeeld inschakelen. Het kan ook aanwijzingen geven over hoe organismen omgaan met veranderende omgevingsomstandigheden, en wat er gebeurt als organismen worden blootgesteld aan gifstoffen. De metaboloom bevat een verscheidenheid aan chemicaliën die het lichaam voor het leven gebruikt, van MoleculES voor energie om cellen te stimuleren om hormonen te signaleren die de vruchtbaarheid veroorzaken en reproductie mogelijk maken.
Een Canadees onderzoeksteam was de eerste die een ruwe volgorde van de menselijke metaboloom ontwikkelde. Dit werk is een uitdaging, omdat monsters uit verschillende delen van het lichaam verschillende chemicaliën zullen bevatten, en deze kunnen ook in de tijd verschuiven. Eenvoudig het sequencen van de verbindingen die in levercellen worden gevonden, zou bijvoorbeeld een ander beeld opleveren dan het bestuderen van weefsel en vloeistoffen uit andere delen van het lichaam, omdat veel delen van het metaboloom zeer locatiespecifiek zijn. Sommige signaalcellen worden alleen in specifieke gebieden gevonden, terwijl specifieke metabolieten in sommige delen van het lichaam kunnen zijn, maar niet op andere. Succesvolle sequencing vereist gedetailleerde en zorgvuldige bemonstering.